| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2882252 = | 122 (0.990) | coding (386/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TGCAAGATGAATGGTTCTGAGACTGGATTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATC > NC_000913/2881936‑2882532 | aacctgatgaattacgcgatatccctgcgttttataggctggtgcaaccttttggttgggaaaacccacgtcaccagcaggctcttttgcgcatggtgttttgcctgagcgcaggaaagaatgtcatccgacatcaggacaaaaaatcggagcaaacaacaggtatctcgttgggaagagctttagccaatagtggaagaattaacgagcgccgtatctttcaattaattcgggctgacagaacagccgatatggtccagttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgac > 1:772240‑M1/299‑299 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aGATGAATGGTTCTGAGACTGGATTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCATTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCCGAAATTGCTGGCGTTCCGCCTTTCCCAACCAGGTCAACATCCTGGCCa > 1:1081309/1‑301 (MQ=255) aattacgcgatatccctgcgttttataggctggtgcaaccttttggttgggaaaacccacgtcaccagcaggctcttttgcgcatggtgttttgcctgagcgcaggaaagaatgtcatccgacatcaggacaaaaaatcggagcaaacaacaggtatctcgttgggaagagctttagccaatagtggaagaattaacgagcgccgtatctttcaattaattcgggctgacagaacagccgatatggtccagttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgaCTGGCCATTaa > 2:409745‑M1/290‑300 (MQ=255) aaTGGTTAGGAGACAGGAATAAACAAAAATTTGAGCGAAAAAACCAATTTTACGAATCGAACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATACTTACTCGTATTTTGCCGCAGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTaa < 1:433810/300‑1 (MQ=255) 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tCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAAGGatatt > 1:297957/1‑300 (MQ=255) tCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACATGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCATATAAAACGCAGGGataga > 2:614482/1‑299 (MQ=255) | TGCAAGATGAATGGTTCTGAGACTGGATTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATC > NC_000913/2881936‑2882532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |