| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2882252 = | 122 (0.990) | coding (386/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TGGATTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGTT > NC_000913/2881959‑2882549 | tgtaTTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAAGAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATTCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTAc < 1:206648/298‑1 (MQ=255) 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gTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGt < 1:457667‑M2/252‑1 (MQ=255) gTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGtt > 1:772240‑M2/2‑299 (MQ=255) GTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGCCGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCTTAATTCATCAGGtt < 1:639443‑M1/299‑1 (MQ=255) GTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGtt < 2:979434‑M1/299‑1 (MQ=255) GTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGtt < 2:610747‑M1/299‑1 (MQ=255) GTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGAGGTTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAACACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGtt < 2:1074376‑M1/299‑1 (MQ=255) | TGGATTCACCAATATTTTGTGCGTAATAACCACTTTTACGCATCGCACGTTTAAGGCTTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAGCTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCTCAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTCCCAACCAAAAGGTTGCACCAGCCTATAAAACGCAGGGATATCGCGTAATTCATCAGGTT > NC_000913/2881959‑2882549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |