| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,757,115 | IS1 (+) +9 bp | 8.5% | intergenic (+5/‑298) | pykF → / → lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 3 (0.040) | 3/542 | NT | 6.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1757123 | 43 (0.590) | intergenic (+13/‑298) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1757115 = | 43 (0.590) | 5 (0.070) | 5/542 | NT | 10.1% | intergenic (+5/‑306) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTACGTAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATACTTGTAACGCTACATGGAGATTAACTCAATCTAGAGGGTAT > NC_000913/1756824‑1757415 | tggCTACTTAGGGCGGTAAAGCTGCTCGCGCAGTACGTAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTtgtg < 2:675743/298‑1 (MQ=255) cTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTACGTAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGTCACTACTAACACCGCATCTGTTCCCGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGaatt > 1:35060/1‑301 (MQ=255) aCGTAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGCGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTCTAATATTCCTTTTGTCACTTAATTTGTATTTCTAAACGCCCTGTTGGgcg > 2:694319/1‑300 (MQ=255) aCGTAAATACTTCCCGGATGCAACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTGCTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGACGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAGAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAGGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTTGTGCACTGGACCCGAGTGGCAATACTAACACTGCATCTGTTCACTACATGAAATATTGCTTCTGTGCTTTAATTTTTATATCTATGCCCCTTGATggtagg > 2:22549/1‑297 (MQ=255) aCGGAAATACTGCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGgcgc < 2:35058/301‑1 (MQ=255) tAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGAACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGATATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 1:618936‑M2/1‑263 (MQ=255) ccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCTTTTGTGAATTCATTTGTATATCGAAGCGCCCTGAGTGGCGATTTTtttattt < 2:287732‑M1/55‑1 (MQ=255) gATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACCAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCATGTAATATTGCTTTTTTGAATTAATTTGTCTCTCTACGCGCCCTCATGTGCGCTTTTTTTTTTTAATCg > 2:508946/1‑301 (MQ=255) ccaccaTCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTTTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTTTTTAATCTATaa > 2:528086/1‑301 (MQ=255) accaTTCTTGCAATGAACACCAACGAGAAAACGTATCATCAGTGGGTACGTAGCGAAGGCGTTGTGACGCAGCGTGTTGAAGAGAGCGGTTCTACTGGTGATTTCTACCGGTGGGGTAAAGAACAGGCGCTGCAGAGCGGTATGGCACACAAAGGTGACGGTGTAGTTAGTGTTTCTGGTGCACTGCTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTGTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAAcc < 2:394872/301‑1 (MQ=255) tCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTGAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGCATTAATTTGTTAATCGAAGCGCCCTGATCGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGaa > 2:227218/1‑301 (MQ=255) gCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCTATATCCAGAAGCAATCAAAAATCAAATCGATTTTAACta > 2:718549/1‑301 (MQ=255) gCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGTTAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACta > 2:284600/1‑301 (MQ=255) catcaGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATGGCTTTTGTGCATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGAGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGc > 2:636883/1‑271 (MQ=255) tcaGGTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta > 1:102676‑M2/1‑206 (MQ=255) ttGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTGCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAAtc < 1:528109/299‑1 (MQ=255) aagggaaagctgaacgtaagcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACtt > 1:287738‑M1/190‑301 (MQ=255) gCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACGTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGAGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGAt < 1:520456/299‑1 (MQ=255) taccTTCTACTGATTATTTGTACCGGCAGGTGAAAGAACTTGCTCGTGAGAGCGGCCTGGCATACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCGGGTACACTGGTACCTAGCGGCAATACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTTCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTtctct < 1:374660/298‑1 (MQ=255) cACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAACGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCCCTTTTTTTATTTAATTGATAACCAGAAGAAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCCCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCCTCTTTTTTtcact > 2:382861/1‑300 (MQ=255) cTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTACTATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAAcc > 1:486513/1‑213 (MQ=255) gatTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGATTTTGTGAATTAATTTGTATGTCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAAGCGATAACAAGAAGAAATAGAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGCATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCACTTTTTTTAt > 1:643180/1‑299 (MQ=255) atTTCTACCGGCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACGACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGggtgatgctgccaacttactgagttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcac > 1:343500‑M2/1‑144 (MQ=255) tttCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGGTATGGTTTATGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACGCCTAACACGGAACCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTATGTGAATTAATTGGTATATAGACGCGCACTGATGGGCGCTTTTTTTATTAAATAGATCACCAACAGACATAAAAAATCTAATCGGATTTTCCTCAATTATGACACTTTCTCTACGATCAATTCGATGGACGCCTGCTATTATCCTTAATTTTTTTTTTCTaa > 1:409326/1‑301 (MQ=255) gCTCTGCAGGGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTg < 1:227224/300‑1 (MQ=255) gtataagagaaagggCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGAGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCg < 1:579068/287‑1 (MQ=255) gTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATCAAAAATCAAATCGGATTTCACTATCTAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCACCGTTCGATGCTTCTTTGATCGAACGTTCaca > 2:552823/1‑299 (MQ=255) ggCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGAGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATCTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTACAACACAGCGTTCGATGCTTCtttccgcgctttctcttctac > 2:579045/1‑282 (MQ=255) aCGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCCTCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTACTCGATAACCAGAAGCAATAACAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATAGAATCGTCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAACCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGAGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTACCAtt > 1:605647/1‑300 (MQ=255) cGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTCATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTTTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATTCTTCTTTGAGCGAACGTTCAAAAATAATTGCATTCCCAta > 2:743121/1‑299 (MQ=255) tGGTTTTCGGTGCACTGGTAACGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATtc < 1:284606/301‑1 (MQ=255) tGGGTTCTGGTGCACTGGGAACGAGCGGCACTAATAATACCGCATCTTTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTCATTTGTATATCTAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATtc < 1:718575/301‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGACTTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGgc > 2:141844/1‑107 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGgc < 1:141850/107‑1 (MQ=255) tgtgtggtttaCTGGGACCGAGCGGCACTACTAACACCGGATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTGTGTTAATTAATTTGTATATCGAAGAGCCCTGACGGGCGCTTGTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCa < 2:643154/291‑1 (MQ=255) cACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGc < 1:154253/126‑1 (MQ=255) cACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGc > 2:154246/1‑126 (MQ=255) tgtactactAACACCGCATCTGTTCCAGTCCTGTAATCTTTCTTTTGGTAATTAATTTGTATATCGAAGCTCCCTGATGTGCGCTCTTTTTATTTTATCGATAACCAGAAGCCATAAAGAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCCAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTTAATTTTTTTATCTAACTCCCTGCGTTCGTTGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCACCATAAAAAACTTTGTGTAATAc < 1:22551/298‑1 (MQ=255) tatgaaaataaaaaactaataaaaaggtggagtcattaccGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATTGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATAc > 2:717101‑M1/41‑301 (MQ=255) gCACTACTAAAACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATAc < 1:508969/300‑1 (MQ=255) gCACTACTAAAAACGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCATTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTGATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATAc < 1:552846/300‑1 (MQ=255) gCACTAATAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATAc < 2:409315/300‑1 (MQ=255) ctactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCAATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCCATTTTTTTATCTAAAACCCATCTTTCGATGCTTCTTTGAGCGCACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCACCATAAAAAACTTTGTTTAATACTTGt > 1:506907/1‑301 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAAc < 1:131336‑M1/249‑1 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAAc > 2:131330‑M1/36‑284 (MQ=255) ctaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGAAAGCATCCTGTTTTCTTTCAATTTTTTTATCTAAAACACAGCGTTCGATGCTTCTTTTACAGAACGTGCAAAAATAAGTTCCTTCCCATCCACAAAATCTTCTCAACATAAAAAACATTTATTAATAATTTTaa > 1:319363/1‑300 (MQ=255) gTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGTCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCGCTATATAATTTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGTAAGCATCCTGTCTTCTCTCAATTTTTTTATTTAAAACCCAGCGTTCGATGATTCTTTGAGCGAACGATACAAAATAAGTGCCTTCCCATACAAAAAATATTCTCAACATACAAAAATTCGTGTAATACTTGTACAGCTACATGGAGAtt > 1:610100/1‑301 (MQ=255) cACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATACTTGTAACGCTACATGGAGATTAAc < 1:382872/301‑1 (MQ=255) cggTAATATGGCTTTTGTGAAATAATATGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACtatat < 1:153358/110‑1 (MQ=255) cTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCTGGTTTCGATATGTAGTCGAACTTTATCTAAGGTGAGTCCTATGGAATCCTCCTGTTTtctctc > 1:112459/1‑162 (MQ=255) cTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACtatat > 2:153351/1‑112 (MQ=255) cTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTtctctc < 2:112454/162‑1 (MQ=255) tttAATATTGCTTTTGTGAATTAATTGGTAGATCGAACCTCCCTGATGGGCGCCTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATACTTGTAACGCTACATGGAGATTAACTCAATCt < 1:743148/299‑1 (MQ=255) gCTTTTGTGAATTACTTTGTATATCGAAGCGACCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAACAATCAAATCGGATTTCACTCTATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCAATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAACACCCAGCGTTCGATTCTTCTTTTCGCGAACCGTCAAAAATAAGAGCCTTCACATCAAAAAAATCTTCTAACAATCAAACAATTTGTATACTACTTGTCAGTCTACATGGAGTTTAACTCAATCTAGAGGGTAt > 2:110008/1‑301 (MQ=255) | TTGCTACTCAGGGCGGTAAATCTGCTCGCGCAGTACGTAAATACTTCCCGGATGCCACCATCCTGGCACTGACCACCAACGAAAAAACGGCTCATCAGTTGGTACTGAGCAAAGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATACTTGTAACGCTACATGGAGATTAACTCAATCTAGAGGGTAT > NC_000913/1756824‑1757415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |