| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1688460 = | 145 (1.040) | 5 (0.040) | 5/570 | 18.3 | 3.4% | intergenic (‑83/‑116) | fumA/manA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I/mannose‑6‑phosphate isomerase |
| ? | NC_000913 | 1688484 = | 136 (0.980) | intergenic (‑107/‑92) | fumA/manA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I/mannose‑6‑phosphate isomerase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCCTGGGGCAGCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTATGGAAAATCCGTCCAGCCAGCCGATGGCCGAGCTGTGGATGGGCGCACATCCGAAAAGCAGTTCACGAGTGCAGAATGCCGCCGGAGATATCGTTTCACTGCGTGATGTGAT > NC_000913/1688163‑1688760 | tCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTGAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATTATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTATCTCACTTACTGACTGGGTTGGTTATGCTATGGTCGGGTGGTTCGTTGCCGTGTTAAACGCGCGTAACAATATCCTacca > 1:969196/1‑298 (MQ=255) gCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACtt > 2:1179841/1‑301 (MQ=255) ccACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTGAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACttt < 2:417905/301‑1 (MQ=255) gggttggtgatggcggagACGAAGCCGGAACGACGCAGCAATAAACGCCTGGAGCGCCAACGGATGTAGAGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTGCGAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATAATCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTa < 1:350564/284‑1 (MQ=255) gtctgttcctcttccgatccgAACGCAGCATNANNNNNNNCNNNNNCNGCCAACNAANTNNNNNNNNNNNNNNCGACTTTNAANAACTCCTGCNNNTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTNNTACTCAGTATCATNNTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACaaaaa < 2:1238541/281‑1 (MQ=255) gcgcCGGACGCAGCATGAACGTCGCATCATGAAACGCCTGGGGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCGGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTga < 2:461270/301‑1 (MQ=255) cgcCGGACTCCGCATGGACGACGCAGCATGAAACTCCTTGAGCGCCCAACGATGTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTGCTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTgag < 1:689209/301‑1 (MQ=255) gcaTGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGAc < 1:973444/301‑1 (MQ=255) gcaTGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCATGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGCGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGATTAGTAAGa > 1:144504/1‑300 (MQ=255) gcaTGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGATTTGTTTGACATTGGTCTCCCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCGGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTACCAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAATACAAGACTAGtcagac > 2:1166601/1‑296 (MQ=255) acgCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTACCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGc < 2:263017/299‑1 (MQ=255) tcgtgctatGGCGCTCCAACAGAGTTAACCCATCGCGTTCCACTTTCAAAATCTCCTCCCCTTCGAATTCAGATACGCTAACGTGGTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGt < 1:871606/292‑1 (MQ=255) aaaCGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGCGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCGCTCACTTACTGCCGGGTTTGGGTATGCTCTGGGCGCGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTCTTTAACACAAACTGAAACAAGTACGCCTTTTTGCgtccccggggt > 1:1227444/1‑290 (MQ=255) aaCGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCAAAACACTTTTTTAACAAAAATCGAGACTAGTCCTACTTTTTTCGGCTCCAGTTTAc > 1:984371/1‑301 (MQ=255) aCGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACt < 2:431434/301‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTACCAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGttccttcc > 2:352198/1‑301 (MQ=255) cTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCTTACACACTTTTTTACCAAAACGTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGtagatccgg > 2:871854/1‑293 (MQ=255) gcgcCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCAGATAATGAAAGAGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTGTGGTTTTGCTCTGGGCGTGTGTTCCGCTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTATAACAAAAACTGTGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTGCTTCCCGTAgg > 2:1163197/1‑301 (MQ=255) cgcCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAAACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCTTAgg > 2:690186/1‑300 (MQ=255) cAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACCTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAACACTTGAGAATAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGtttt > 1:507902/1‑300 (MQ=255) aaCAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAACGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGCAGTATTCt > 1:359639/1‑301 (MQ=255) aCAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGATCAGTACGACTATTTGCGGCTCCATGTAATTTTCCGTTGGATTCtt > 1:307947/1‑301 (MQ=255) 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cacacTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCCTGGCGCACCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTGTGCAAAATCCGTCCAGCCCGCCGATGGCCGAGCTGGTGGTTGGCGCACACCCGGAACACAGTCAGCGCGTGCAGAAAGCCGGCGGAGATAACGtttacctcgctgctgtcgt > 1:284700/1‑285 (MQ=255) | TCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACTGAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCCTGGGGCAGCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTATGGAAAATCCGTCCAGCCAGCCGATGGCCGAGCTGTGGATGGGCGCACATCCGAAAAGCAGTTCACGAGTGCAGAATGCCGCCGGAGATATCGTTTCACTGCGTGATGTGAT > NC_000913/1688163‑1688760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |