New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1688460 = | 145 (1.040) | 5 (0.040) | 5/570 | 18.3 | 3.4% | intergenic (‑83/‑116) | fumA/manA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I/mannose‑6‑phosphate isomerase |
? | NC_000913 | 1688484 = | 136 (0.980) | intergenic (‑107/‑92) | fumA/manA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I/mannose‑6‑phosphate isomerase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCCTGGGGCAGCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTATGGAAAATCCGTCCAGCCAGCCGATGGCCGAGCTGTGGATGGGCGCACATCCGAAAAGCAGTTCACGAGTGCAGAATGCCGCCGGAGATATCGTTTCACTGCGTGATGTGATTGAGAGTGATAAATCGACT > NC_000913/1688194‑1688779 | gcaTGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGAc < 1:973444/301‑1 (MQ=255) gcaTGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCATGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGCGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGATTAGTAAGa > 1:144504/1‑300 (MQ=255) gacgCTTCATGAAACGCTTGGCGCGCCAACAGGTTAAAAGTGTCGGGTGCGACTATCAAAATCTACTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAGCGTGTTCGCTGGTTAGGAGGTAATACTCAGTATCATCTGTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTGGTTTGACAGTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCg < 2:1228582/301‑1 (MQ=255) acgCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTACCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGc < 2:263017/299‑1 (MQ=255) tcgtgctatGGCGCTCCAACAGAGTTAACCCATCGCGTTCCACTTTCAAAATCTCCTCCCCTTCGAATTCAGATACGCTAACGTGGTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGt < 1:871606/292‑1 (MQ=255) aaaCGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGCGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCGCTCACTTACTGCCGGGTTTGGGTATGCTCTGGGCGCGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTCTTTAACACAAACT‑GAAACAAGTACGCCTTTTTGCgtccccggggt > 1:1227444/1‑290 (MQ=255) aaCGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCAAAACACTTTTTTAACAAAAATC‑GAGACTAGTCCTACTTTTTTCGGCTCCAGTTTAc > 1:984371/1‑301 (MQ=255) ccTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTACCAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGttccttcc > 2:352198/1‑301 (MQ=255) gcgcCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCAGATAATGAAAGAGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTGTGGTTTTGCTCTGGGCGTGTGTTCCGCTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTATAACAAAAACT‑GTGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTGCTTCCCGTAgg > 2:1163197/1‑301 (MQ=255) cgcCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAAACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCTTAgg > 2:690186/1‑300 (MQ=255) cAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACCTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAACACTT‑GAGAATAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGtttt > 1:507902/1‑300 (MQ=255) aaCAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAACGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGCAGTATTCt > 1:359639/1‑301 (MQ=255) aCAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGATCAGTACGACTATTTGCGGCTCCATGTAATTTTCCGTTGGATTCtt > 1:307947/1‑301 (MQ=255) agagTTCACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGTTACGCTGACGTGTTCGCTTGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGc < 2:501474/301‑1 (MQ=255) gagTTAAGTCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCt < 2:964962/301‑1 (MQ=255) gagTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATCATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGTGCGGGTGTTCCTTTTCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAAGAACCTACAAACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCCGTTTACTTTCTGTTAGATTCTTGCt > 1:1075970/1‑301 (MQ=255) gagTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACATTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTATTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTGACTTCTCGTAGGATTCTTGCt > 1:541171/1‑301 (MQ=255) gagTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTTTTGCt > 1:811630/1‑301 (MQ=255) aagTTAACACTTCGGGTGCGACTTTCAAAACCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCt < 1:1179527/300‑1 (MQ=255) gTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCttt > 2:399640/1‑301 (MQ=255) cGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTTCTTTAATAGTTGGATTAAtt > 2:975813/1‑301 (MQ=255) aaCTTTCAAAATCCCCTGCCCTTCAAAATCAAATGCGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAAttt < 2:144548/300‑1 (MQ=255) aaaattgtcTGCCCTTCAAATTCAAATACGCTAACGGGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATAATTAGTATCAGCTTTTTTGAGTGGAAAAGGGGCCTGATAATGTAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCcaca < 1:385430/291‑1 (MQ=255) aaaaTCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCcacaa > 2:385545/1‑299 (MQ=255) ccttgcaatttcggtACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGAtt < 1:689974/287‑1 (MQ=255) 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aaCAAAAACT‑TAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATTCAAAAACTCATTAACTCAGTGAAAAACTATGCCTGGGGCAGCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTATGGAAAATCCGTCCAGCCAGCCGATGGCCGAGCTGTGGATGGGCGCACATCCGAAAAGCAGTTCACGAGTGCAGAATGCCGCCGGAGATATCGTTTCACTGCGTGATGTGATTGAGAGTGAt < 2:359745/300‑1 (MQ=255) | GCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAGATACGCTAACGTGTTCGCTGGTTAGCAGGTAATACTCAGTATCATCTTTTTTGAGTGGAAAAGGAGCCTGATAATGAAAGGGTTTGTTTGACATTGTTCTCTCACTTACTGCCTGGTTTGGTTATGCTCTGGGCGGGTGTTCCGTTGCCCTGTTAAAAGCGAGTAACAATATCCTACACACTTTTTTAACAAAAACT‑GAGACTAGTACGACTTTTTGCGGCTCCAGGTTACTTCCCGTAGGATTCTTGCTTTAATAGTGGGATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCCTGGGGCAGCAAAACGGCGTTGACTGAACTTTATGGTATGGAAAATCCGTCCAGCCAGCCGATGGCCGAGCTGTGGATGGGCGCACATCCGAAAAGCAGTTCACGAGTGCAGAATGCCGCCGGAGATATCGTTTCACTGCGTGATGTGATTGAGAGTGATAAATCGACT > NC_000913/1688194‑1688779 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |