| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1237052 | 154 (1.100) | 5 (0.040) | 5/562 | 18.1 | 3.2% | coding (190/1533 nt) | ycgB | SpoVR family stationary phase protein |
| ? | NC_000913 | = 1237064 | 155 (1.130) | coding (178/1533 nt) | ycgB | SpoVR family stationary phase protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
GTAATATATTTACGGGCAAAAATCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCC‑ATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTG > NC_000913/1236769‑1237362 | gTAATATATTTACGGGCAAAAATCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATCCAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGCCCAGTGCGGAAAGTTAATTTGCATGCCGATGCTTGGTTAGGccc > 1:528515/1‑299 (MQ=255) tACGGGCAAAAATCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATTATCTg > 2:624598/1‑301 (MQ=255) aaaaTCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTTCGGATAGTTAATTGGCCTGCCGCCGCTGGAGTAGGCATCCATCATATGTTCTGAgg > 2:25414/1‑301 (MQ=255) aaaTCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTACTGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCCGTCCCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGGTTATTGGCATGCCGACGCGGGAGTAGGCATCCATCATCTATTCTGatgg > 1:3026/1‑298 (MQ=255) tCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATGTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCCGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGCCGCTGGAGTAGGcatccaagattggaagagggtggtg > 1:389077/1‑282 (MQ=255) tCAGAAAAACGACAAGCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGcatcca < 2:389192/282‑1 (MQ=255) aGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGAGACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCGGACCGTGCTTATACAGCCGTTCTGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGCTAGTTAATTTGCCTTCCGTGGCTGGAGTAGGCATCCACCATCTGTTTCGTGGTTATct > 1:1128835/1‑300 (MQ=255) gccGAACTGGCGTCCGTCCGCCTACGGAATCAGTAATTGTTTTGTAAGAAAGAGGTATGCCCCTAGCAGGCCATG‑GCCATCACCCGTGCTTGCATGGTAATGGTTTTCTCTTCCAGCAGGTAAGCGTTACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGGAAGTCCTTGCTGACCGTGCGTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACGTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGt < 1:907193/299‑1 (MQ=255) aTCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTTTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGt < 2:111093/301‑1 (MQ=255) aTCGAACAGGGGTCGGTCAAGCGACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGt < 2:283420/301‑1 (MQ=255) agcggCGTCAGTCAAGCTACGGAATAAGTGATTGTTTGGTGAGAAAGGGTTATGCGCATAGCAGG‑CATGAGACATCCCCAGGGCTTGAATGGTAATTGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACAGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCggg < 1:952162/298‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTTGCATGCCGACGCTGGAGGAGGCCTACatcatc > 1:631954/1‑268 (MQ=255) aCTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCggg < 2:669959/301‑1 (MQ=255) gggCGTCGGTCCAGCTACGGAATAATTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCAATAGAAGG‑AATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACTGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggt < 1:16783/299‑1 (MQ=255) ggCGTCTGGCCAGCTAAGGAATAAGTAATGGTATTTGAAGAAAGATGTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtag < 2:1212444/301‑1 (MQ=255) gCGTCTGTCCCGCAACGGATTAAGTATGTTTTTTTGAAGACATGGGTATGCCCATTGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTGCATCAGGTAGGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGTCCAGTCCTTGCTGACTGTGCTTAGACAGCCGTTCAGTCTCGTGAAACTTTTTACCGAATGTCCAGTGCGGATAGTTAATTGGCAGGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtagg < 1:319695/301‑1 (MQ=255) tACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTTGTGCGGGTAGGAATACAggtggt > 2:113361/1‑295 (MQ=255) gattacttAATTGTTTTGGAAAAAAAAGTTATGCCCCTAGCCGG‑AAGGCGCCAGCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCCTGCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGACAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGCAGAACGTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACTCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGCTAGGTATCCAGCCGGTAGAGt < 1:61173/294‑1 (MQ=255) aaataatGAATTGTATTGTATGAAAAAATTATGCCCAGAGCAGG‑GTTAGGGCATCACCAGCGTTTGCATGGTAATGGTGTTCTATTCCATCAGGTAAGCAATAAACGGGTTAGATTTAATGACGATGTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGt < 1:454640/300‑1 (MQ=255) tAAGTAATGGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAATCTAGATAAACTTTATAACGAATGACAAGTGCGGATAGTTAATTCGTATGACGACGCTGGAGTAGGGATCCATAAACTGTTCTGCGGTTATCACATAAATCTGGTGCTGGTAGGTTTCAAGCCGGTAGAGtttg > 2:552296/1‑300 (MQ=255) aaGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATAATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCg > 2:594931/1‑301 (MQ=255) ttttGAAGCAAGGGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGcc < 1:205920/279‑1 (MQ=255) ttttGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGcc > 2:205992/1‑279 (MQ=255) tGAAGAACGAGTTATGCCCATGGCAGG‑CATGAGTCATCACCCTCGCTTGCATGGTAAGGGTTTTCTCGTCCATCAGGTAAGCGATACACGGTTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGCCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTa < 2:503710/300‑1 (MQ=255) gagTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGcc > 2:1164660/1‑300 (MQ=255) 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cggg‑CATGCGCCATCACCCGGGCTTGCGTGGTAATTGTGTTCTCTTCCAGCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcagca < 1:1164353/299‑1 (MQ=255) gg‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTTCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTTCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTTTGCCAGATAAACATCCAGCCgg > 2:806684/1‑301 (MQ=255) g‑CATGAGCCATAACCCGCTATTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACTATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGt < 2:944061/301‑1 (MQ=255) tCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTCCTTATACACCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGCCGCTGGGGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGACTTTCGCCACCCGGCCTATCTCTGCCAGATAAACACCCAGTCGGTCGAACGcccc > 2:907183/1‑300 (MQ=255) cAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCt < 2:311516/191‑1 (MQ=255) cTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTcc > 2:584006/1‑301 (MQ=255) 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gTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCATATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCC‑ATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTg < 2:782895/301‑1 (MQ=255) tAGGCATCCATCCACTGGTCGCTAGTTATCCATTCAATCATGTGCTGGTAGCTATCCATCCCGTAGCGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGCCGAACGACCAGTAGGGTCC‑ATCGCTCAAACGTGTTGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTg < 1:933949/300‑1 (MQ=255) | GTAATATATTTACGGGCAAAAATCAGATAATCGACAATCGAACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGG‑CATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCC‑ATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTG > NC_000913/1236769‑1237362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |