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tGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGt < 1:693694/301‑1 (MQ=255) aaCCCGAAGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAatat < 2:932184/301‑1 (MQ=255) aGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAAttattt > 1:341257/1‑301 (MQ=255) gTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAAccc > 2:442340/1‑61 (MQ=255) gTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAAccc < 1:442350/61‑1 (MQ=255) aGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGt < 2:745096/78‑1 (MQ=255) aGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGt > 1:745116/1‑78 (MQ=255) | TATTTTAGTCGTACGGGGAGAAAGGAAATTCCTTCCGGCAATAGAACGAAACGAATATTGATAAATGTTCCAGGTATTTATAGTGACAGTTTTTGGGCGTCTATAATACGTGGAGAACTATCAGAGCTTTCACAGCCTACAGATGATGAATCGCTTCTGAATATGAGGGTTAGTAAATTAATTAAGAAAACGTTGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAACCGATTACAGAAATAAAATTATTT > NC_000913/1210661‑1211187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |