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atGAAGCAATGCGGCCTCTTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTAcc < 1:884512/301‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTc < 1:323534/151‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTc > 2:323526/1‑151 (MQ=255) ttaGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACGACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGc < 1:941480/301‑1 (MQ=255) gTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGata < 1:603091/300‑1 (MQ=255) gTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACAAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGCCTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTGGGCTGTAattt > 2:69221/1‑299 (MQ=255) gTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAAGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGCTAATAAATGTAATATGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGCAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGCACTGATCCATCAGGATAATAACCTAGTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTCTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGATCTTTCCTTTGGCTGTGat > 2:201981/1‑299 (MQ=255) | CTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATTCCCGAAATGTAGATTTTCCGCAAATATGAAGCAATGCGGCCTCTTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATAT > NC_000913/1212638‑1213198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |