| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2753985 | 185 (1.080) | 8 (0.050) | 8/544 | 19.2 | 4.3% | intergenic (+39/+23) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| ? | NC_000913 | = 2753986 | 180 (1.100) | intergenic (+40/+22) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAACGGCA > NC_000913/2753691‑2754284 | gACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCt < 1:564742/301‑1 (MQ=255) aaCTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCCTTTGGTACGACTACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCACGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAATCGCTGACGCTGCCCATTAACAGTAGCGGTGTGTTGATCAATGTTGATCACAATACATG‑GCTGATTGGTAACTAATACAGAAGTAGCTTTGAAAGACGTTAAACAAGGTGCTCTATGAGCCACTTTGATCTGTATG‑ttt > 2:1190733/1‑300 (MQ=255) aCTATCTTACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑ttat < 1:778442/301‑1 (MQ=255) gcgaaagacgTATCCAAAATACATGTTGGAATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATAGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTtctgtc < 1:735957/278‑1 (MQ=255) gCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑CACTGCGCTGCGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCCCAAAGAAGTTAAAAAAGTTACTAAATAAGCCCCTTTTTTCGGTTTT‑TTATTTATTCCCTgt > 2:474123/1‑300 (MQ=255) ccaacgTATCCAAAATCCGTGGTGGCAGGACGCAACAACAATTTGGGTACGCATTGGTTACACCTCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGAtttt < 2:823524/298‑1 (MQ=255) aacttATCCAAAATACGTGTTGGCAGGACGCAACAACAATTTGCGTACGCATTGGGTAAACCGCTGATGTCCGATCCAGTTGGGACGAAGACCTGGTGCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTc < 2:457252/297‑1 (MQ=255) acgTATCCAAAATACGTTTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTc < 1:692458/300‑1 (MQ=255) acgTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGTCCAATATTGATACCAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTTAAATACATTAAAAAAGATGTTCATTGAGCACCTTTTTTTTGTTTG‑TTATCTATGCGTGGATTTTTCt > 2:692284/1‑301 (MQ=255) gTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTATCAAAGACGTTAAAAAAGAGTCTCAATAATAACCGTTTTTCT‑TATGTTTATTTTTTGGCTGtttttttgtt > 2:1524633/1‑297 (MQ=255) cAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCg < 2:37045/299‑1 (MQ=255) cAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCg > 1:37047/1‑299 (MQ=255) aaaaTACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGttt > 2:716325/1‑300 (MQ=255) cGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAACGACGTTAAAAAAGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCTCTGATTTTTCTGCTCTTTGCCTGCg > 1:1356128/1‑301 (MQ=255) gCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATGAAGTTGATCTCAAAGACGTTAACAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTTTTCGCTGATTTTTTTTCTCTTTGCTTGCTAAgtttt > 2:559237/1‑297 (MQ=255) cggcaaTTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATTCAGTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGc < 2:446794/298‑1 (MQ=255) tGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCA‑TTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATATTAAAGTTGCTCTCAAGGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTCCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATTAGAgg > 1:823182/1‑301 (MQ=255) ggcatACTCATAGGGTACACCGCTGATGGCCGATCCATTTGGTAAGAAGACCTGTTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGTTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACATGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTAAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGagag < 1:1027375/297‑1 (MQ=255) cGTATGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGTTCCATTTGGTACGAATGCCTGGTTCTATGTCGTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAATACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCAGCAATGAGAggg < 2:1553530/301‑1 (MQ=255) ccacCGCTGATGTCCCAGCCAGTTGGTACTAATACCTGGTTCTATGTCTGCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTTCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCAc < 1:535914/300‑1 (MQ=255) cacCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGATTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGTAGCTCAATGAGAACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGCTTTTTCTGCTCTTTGCCTTGGAAGCTCTTTCGTCTCGGCCATGAGTGGGCGATAAAACTCcccc > 2:778220/1‑301 (MQ=255) gcgactgctgTCCGTTCAAGTTGGAACATATATCTGGTTGTTGGGCTTCCGACCGGAGACAGGTCACGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTTGCATTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGATGAGTGGTAACTAATAAGAAAGTTTATCTCAAAGACGTTAAATAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTTTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCAccc < 2:483667/297‑1 (MQ=255) ccGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAATCTCTTTCGGATCGGCAATGAGGGTGTGATAAATCTCCAccc > 2:898162/1‑300 (MQ=255) tGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAATAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGTCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGCTCg > 1:155363/1‑301 (MQ=255) aTGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCGCTTTCg > 2:1129428/1‑261 (MQ=255) ccGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATg > 1:254238/1‑191 (MQ=255) gATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGTTCTTTCGGCTCGGCAATGAGAGGGCGTTAAATCTCCACCCGATCGCcctcatc > 1:563025/1‑300 (MQ=255) gATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCg > 1:1412508/1‑255 (MQ=255) tatgctcttccgatctACCTTGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATg < 1:1132561/284‑1 (MQ=255) ccatttgtacagAATACCTGGTGCAATTTCTTTCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGCCGCTTACCTTTAACATCAGCGGTGTCGTGACCAATATTGCTCACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGcac < 1:1320007/290‑1 (MQ=255) cATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAAtc < 1:477662/277‑1 (MQ=255) gTACAAATACCTGGTTTTATGTCGTCCTCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATATCAA‑ACCTGCGCTGAGTAGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCg < 1:399854/301‑1 (MQ=255) tACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca > 1:807500/1‑292 (MQ=255) aCCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCCCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCAACCGATCGCCATCATgtgatcggaagagcgtggg > 2:1132257/1‑283 (MQ=255) ccTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATc > 1:518934/1‑273 (MQ=255) tCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGACGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCCTGAACACTATCGCTTAGTTTTGCCggg > 2:1513580/1‑300 (MQ=255) acgtcgctcttccgagctggTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGGTGCTGAACTTTAACAGTAGAGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCt < 2:255531/283‑1 (MQ=255) ttccctacacgaccaccttccgatcttgtAACTCAGCAAACGCTTACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTg < 2:664968/273‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTg < 2:812484/298‑1 (MQ=255) cgacAGCAAGCAGATCATGAAGGAGTAAGTCAACAAACGATGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAT‑ACCTGCGCTGAGTGGTAAGTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTGTCTGTCTG‑TTAGTTAATCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTAGCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAAt < 1:1191058/298‑1 (MQ=255) cGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGCTTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATTCCAACTACAGCTTCGTTTTACCGGGCGGCTGTaaa > 2:288516/1‑300 (MQ=255) cGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTTCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCAACCCGATCGCCATCATGCCCACTAACGGTTATTTTTGCCGGCCGGCTGTaa > 1:1523832/1‑299 (MQ=255) gCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGcagatcggg > 1:1548121/1‑293 (MQ=255) 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cAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCGCTGGCGCTAATAGCTTCTTCAACCGGCGCGCCCTCCTGCACCGTCACTCCCTGCCGGGAcgtgtcttagcgtgg > 2:163168/1‑287 (MQ=255) cGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATCGCGTCTTCAACCGTCTCCACCTCCTGCCGCGTCCCCCGCTGCGGGTACTGCCTCCCAGGTAgggcct > 2:1006701/1‑298 (MQ=255) gTTAAAAAAGGTGCTCAATTAGAACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTAGTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATa < 1:644360/300‑1 (MQ=255) gaaaaaaGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCACGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCCGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGc > 1:623713/2‑301 (MQ=255) tGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCCCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAAc > 1:883210/1‑301 (MQ=255) tCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCCCAGTGAGCGCATAAGCCACCTCAACGGc > 1:1202455/1‑301 (MQ=255) | TCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAA‑ACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTG‑TTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAACGGCA > NC_000913/2753691‑2754284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |