| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 517096 = | 525 (1.300) | coding (514/780 nt) | fetB | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 509 total aligned reads displayed.
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1:5059275/251‑1 acaacaATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAAtt < 1:1754445/125‑1 caacaaTTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCt > 2:4684657/1‑155 caacaaTTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgctgc < 2:1150687/251‑1 aTTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTg > 1:4782186/1‑155 aTTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGAGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGGCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGACTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATAATGGTGACCTTTATTCTGCTCTCa > 1:1792872/1‑251 ggCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTc < 1:1270764/99‑1 ggCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTc > 2:1270512/1‑99 gCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc > 1:2559621/1‑236 ggTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCtt < 2:1482110/225‑1 ggTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc > 2:3416969/1‑230 cATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCt > 2:2120263/1‑134 ttAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCa < 1:837177/146‑1 cAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTg > 2:4190886/1‑129 cAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTc < 1:3693388/149‑1 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ggAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAAc > 1:4720697/1‑249 gaataactaggTCTGGGTGCGCCGCTGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTATTGCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCt < 2:1792547/240‑1 aaaCTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGGGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCt < 1:5704146/235‑1 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCgg > 2:5594929/1‑153 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 2:5568021/192‑1 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGttt > 1:1016731/1‑251 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGttt > 1:2775716/1‑251 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCAACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGGTc < 1:3855410/150‑1 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ACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAA > NC_000913/516831‑517319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |