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Only 100 of 553 total aligned reads displayed.
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gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGc > 1:2572697/1‑129 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 2:5568021/192‑1 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGttt > 1:2775716/1‑251 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGttt > 1:1016731/1‑251 gTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCAACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGGTc < 1:3855410/150‑1 tGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 1:321538/188‑1 gTGCGAGGCCGAAGCAGGTTCCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATaa < 2:2295625/250‑1 gTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGAcc < 1:1182921/179‑1 gTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGAcc > 2:1182675/1‑179 ccGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 1:5316290/178‑1 gAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGa < 2:1354428/140‑1 ggCTCCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAACCGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCattat < 1:4511099/201‑1 cAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGttt > 2:66817/1‑82 cAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATc < 2:2604141/123‑1 cAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATc > 2:1844727/1‑123 cAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCgg < 1:2318159/126‑1 gCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 1:208748/163‑1 gCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 2:2493603/163‑1 cGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTggtggt < 2:5293381/247‑1 gATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc < 2:1955738/161‑1 atatTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc > 2:1490425/1‑160 atatTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc > 2:116309/1‑160 atatTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTAtgc > 1:564902/1‑160 atatTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGACGCa > 2:2884716/1‑251 atatTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGACGCa > 1:4685344/1‑251 | TGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTATTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGATATTTGCCGGGATTGATCCGGTGAAGGCGATTAAATATCAGATTATGGTGACCTTTATGCTGCTCTCAACCGCCAGCTTGTCGACCATTATTGCCTGCTATTTAACCTATCGTAAGTTTTATAATTCGCGCCACCAGTTGGTGGTGACGCA > NC_000913/516846‑517346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |