New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1482221 | 112 (0.820) | 4 (0.030) | 4/506 | NT | 3.6% | intergenic (+20/+34) | ynbD/azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent |
? | NC_000913 | = 1482229 | 108 (0.830) | intergenic (+28/+26) | ynbD/azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CTATTTTTGTGTACCGATGCTGGATCTGGTGGTTCCGGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGC‑TGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCATCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCTCGGTATAGCGGAAAGTAACGCCTGCGCG > NC_000913/1481922‑1482521 | tttttgGTGTACCGATGCTGGATCTGGTGGTGCCGGAAGGGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAat < 2:194535/300‑1 (MQ=255) gtgaggggtGCTGGATCGGGGTGGCCCGGAGGGGGGGGGGCTCCGACAGGCCGGGGCGAGGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATGGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGGTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATGGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGACTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑Ac < 1:1148389/292‑1 (MQ=255) tgcacttggccggcgcgtagggtGCCGGAAGAGGGGGATCGACAGCAGGCCGTGGCGATGCTAGAAACATGACGCGAAGAGCAAGTCAGCTTGCTGGTCCAGTGGTCATTGGTATGATCGAGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATTGTTGGTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATGAGCTATATTCGAGACAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAg < 1:176692/281‑1 (MQ=255) ccGATGCTGGCGCTGGGGGTTCCGGAAGAGGGGGAGCTCCTAAAGGCCGTGGCGATGCGGGAAACATTACTCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCAGTTTGCATTGGGATTATCGCGCCTGGCGCTGGGGTGGGCGGCATGGTTGTTACGTTACGGATACTGTAAAAACGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTTAGAGTATGGGACAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAGTcc < 1:1256701/301‑1 (MQ=255) gATCTGGTGGTTCCGGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCCGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACCGTCCAACTCAAGa > 2:60283/1‑301 (MQ=255) tgcgggtgatgacGGAAGAGGGGGAGCGCCGAAAGGCCGTGGCGATGGTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGGGCTGGTCCAGTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGTATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATGCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAGTCCACATCAAGAc < 2:460801/289‑1 (MQ=255) atcggtgggtTCCGGAAGAGGGGGAGTGCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCATCGTTCTGGTCCAGTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCGGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAGTCCACATCAAGAc < 2:586908/294‑1 (MQ=255) 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CTATTTTTGTGTACCGATGCTGGATCTGGTGGTTCCGGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCT‑ACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGC‑TGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCATCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCTCGGTATAGCGGAAAGTAACGCCTGCGCG > NC_000913/1481922‑1482521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |