| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1482221 | 112 (0.820) | 4 (0.030) | 4/506 | NT | 3.6% | intergenic (+20/+34) | ynbD/azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 1482229 | 108 (0.830) | intergenic (+28/+26) | ynbD/azoR | putative phosphatase inner membrane protein/NADH‑azoreductase, FMN‑dependent | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GTGTACCGATGCTGGATCTGGTGGTTCC‑GGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCATCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCT‑CGGTATAGCGGAAAGTAACGCCTGCGCGGGCAA > NC_000913/1481930‑1482526 | tttgaccgtggCTTGATCTGG‑GGTTCCTGGAAAAGTGGGGGCGGCGACATGACGTGGATATAGTGGAAATGTTATGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTATGGTCCATTGTGTATTGGGATTATCGCGCAGTTCGCTGGTGGTAGCGGCATCGTTATTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATGGTGCTTACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTAc < 1:1317551/291‑1 (MQ=255) gtgaggggtGCTGGATCGGGGTGGCCC‑GGAGGGGGGGGGGCTCCGACAGGCCGGGGCGAGGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATGGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGGTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATGGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGACTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTAc < 1:1148389/292‑1 (MQ=255) tgcacttggccggcgcgtagggtGCC‑GGAAGAGGGGGATCGACAGCAGGCCGTGGCGATGCTAGAAACATGACGCGAAGAGCAAGTCAGCTTGCTGGTCCAGTGGTCATTGGTATGATCGAGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATTGTTGGTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATGAGCTATATTCGAGACAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAg < 1:176692/281‑1 (MQ=255) ccGATGCTGGCGCTGGGGGTTCC‑GGAAGAGGGGGAGCTCCTAAAGGCCGTGGCGATGCGGGAAACATTACTCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCAGTTTGCATTGGGATTATCGCGCCTGGCGCTGGGGTGGGCGGCATGGTTGTTACGTTACGGATACTGTAAAAACGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTTAGAGTATGGGACAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAGTcc < 1:1256701/301‑1 (MQ=255) gATCTGGTGGTTCC‑GGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCCGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACCGTCCAACTCAAGa > 2:60283/1‑301 (MQ=255) tgcgggtgatgac‑GGAAGAGGGGGAGCGCCGAAAGGCCGTGGCGATGGTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGGGCTGGTCCAGTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGTATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATGCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGAc < 2:460801/289‑1 (MQ=255) atcggtgggtTCC‑GGAAGAGGGGGAGTGCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCATCGTTCTGGTCCAGTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCGGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGAc < 2:586908/294‑1 (MQ=255) 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cTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCATCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTCATAACGATGGCTTTTCTGCCCGTTTCCATACCTTCCGTTCC‑TGCTCCGGCGTCGCGGAGAGTAACGGCTGCGGGGGCac > 1:879405/1‑299 (MQ=255) | GTGTACCGATGCTGGATCTGGTGGTTCC‑GGAAGAGGGGGAGCTCCGACAGGCCGTGGCGATGCTGGAAACATTACGCGAAGAGCAAGGCAGCGTTCTGGTCCATTGTGCATTGGGATTATCGCGCAGTGCGCTGGTGGTGGCGGCATGGTTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGA‑TGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAGCCGAGGAACGTGGACAGATACGGCGTCACCAGGTCCGTTGGTCCATCTTTGTGGATCCCGCCGCGGCTGGTAATAACGATGGCTTTTTTACCCGTTACCAGACCTTCCGGACCGTTCT‑CGGTATAGCGGAAAGTAACGCCTGCGCGGGCAA > NC_000913/1481930‑1482526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |