New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3242787 = | 189 (1.280) | coding (528/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TAGTCAGAGAAACGCCCCAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGAT > NC_000913/3242461‑3243058 | ccccaaactacgcgcacgaatctgtgcgatctggatcagtatcgctatcaacctgattttcaggagctgcctgcggaagcggcagatcgtgaagtgcagatctatcgtcgcgctaacggcgatgtcggggtgcgtaatgagctgtggatcctgccaaccgtgggctgtgtcaacggcatcgcgcggcagatccagaaccgttttctgaaagagaccaacaacgccgaaggtactgacggcgtgttcctcttcagccacacctacggctgctcacagctgggcgacgatcacattaataccc > 1:368525‑M1/301‑301 (MQ=255) 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agaAACGCCCCCGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCCCCGCCCTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCGGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGGTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTATTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCAc < 1:1079631/298‑1 (MQ=255) aaaCGCCCCCGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGGTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTGGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGTCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGt < 1:156119/301‑1 (MQ=255) ccccAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTTCTTTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATAACGCCCAGCGTTTCACGGCATGCGGCAACCCGGTTGTTTTCACCGCCCAGCCCCATCCCCCGCCATCCCCCCGCGTTCGGGGTGCGGCCCACGTTTTgg > 1:1311870/1‑300 (MQ=255) 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aTACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTAACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACAATGTTTTGCAGCCTGGTGCGGGTATTAAttt > 2:1173016/1‑299 (MQ=255) aCCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACAAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGc < 2:64955/299‑1 (MQ=255) ccGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCATTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCCCTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTCATGTGATCTTCGCCCa > 1:296608/1‑301 (MQ=255) 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cGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTATGTGTGGCTGAAGAGGAac < 2:230505/95‑1 (MQ=255) cGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAac > 1:230501/1‑95 (MQ=255) tGGCGCCCCATTGTTTTCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCCGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTGCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGAt < 2:528909/301‑1 (MQ=255) ggCGCACCAGGTTTGGCGGAATGGTGGGGGGATGAAGGTGATCGTCGCGCAGCGGGGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGAt < 1:263983/300‑1 (MQ=255) | TAGTCAGAGAAACGCCCCAGCATCGGGTTAGCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGAT > NC_000913/3242461‑3243058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |