New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3242787 = | 189 (1.280) | coding (528/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGATCGCTCAGATTCGTGCGCGTATTGTGGGCG > NC_000913/3242491‑3243087 | tgagaaaaaacagagagccctccAGAACCACCGGAATCCAGACCAAACTTCAGCTGGAGGAGTTTGCCTGACTCGTGTTTATCTTTGCGCATCACGTTATACGGCTGATGCAAATGCGCGATTCCGGCGTCGAGCTCATCAGCCTGCTGTTGGCAGATCATTAAATGAACGCGGTGAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTGTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTa < 1:678265/278‑1 (MQ=255) 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cAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACGTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCGTCATCCTGCTGTTAGCAGATCGTGAAAGGAACGCGTGCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTa < 2:447333/299‑1 (MQ=255) aaTACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTGGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAAtg < 2:1110562/301‑1 (MQ=255) aaaaGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGAtcgt < 1:63743/300‑1 (MQ=255) 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GCAGTAATACCAGAAAGACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCATCCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGATCGCTCAGATTCGTGCGCGTATTGTGGGCG > NC_000913/3242491‑3243087 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |