| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2192485 | 190 (1.080) | 3 (0.020) | 3/526 | 26.8 | 1.8% | intergenic (‑263/+30) | yehD/yehE | putative fimbrial‑like adhesin protein/DUF2574 family protein |
| ? | NC_000913 | = 2192449 | 159 (1.030) | intergenic (‑227/+66) | yehD/yehE | putative fimbrial‑like adhesin protein/DUF2574 family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GAAAAGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGA > NC_000913/2192188‑2192743 | gaaAAGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTa > 2:1363608/1‑301 (MQ=255) aaaaGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCt < 1:318118/299‑1 (MQ=255) aaaaGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCt < 1:1377067/299‑1 (MQ=255) aaaaGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCAGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTaa > 1:1505692/1‑301 (MQ=255) 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ttgttgAAATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGAAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAaga < 1:682214/301‑1 (MQ=255) atCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGACATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGCATGCgg > 1:39901/1‑301 (MQ=255) acAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCggg < 1:817612/300‑1 (MQ=255) acAATAAAAAAGCAGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCggg < 1:651154/300‑1 (MQ=255) cAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGga > 2:1287906/1‑301 (MQ=255) cAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACAATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAAGGCGGga > 1:105590/1‑301 (MQ=255) | GAAAAGACAGCGGCAGCAATAATTGAACGTTTCATAATATGTTCCTTAATAAAATTTATTTTTGGTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGA > NC_000913/2192188‑2192743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |