New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2982463 | 204 (1.140) | 6 (0.030) | 6/556 | 24.0 | 3.0% | intergenic (‑281/+34) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase |
? | NC_000913 | = 2982467 | 192 (1.100) | intergenic (‑285/+30) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TCCGTATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCAC > NC_000913/2982163‑2982757 | gTATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGAAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATg < 1:994567/301‑1 (MQ=255) gatggATAGTGACCATGATTTGCGGCCCGCAGAGAGTAAGACAGAAGGAAAAAATACGGGAACAACGCAAGAAGGTGTCAGGTCGGAAAAAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACGTGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTACAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATGGTACAGCAGATAAAATGCAGAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATGTCATAGCCATGATATGTAGTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCAAGc < 1:224944/297‑1 (MQ=255) tAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGACGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGAAgg > 1:1369431/1‑301 (MQ=255) aGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAgg < 4:552773/300‑1 (MQ=255) tAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAg > 4:1268069/1‑297 (MQ=255) aaCCATTTTTTCCTGACAGCAGAGAGTAAGACAGAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCa < 1:1317971/301‑1 (MQ=255) tttttCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATaaaa < 4:343415/300‑1 (MQ=255) 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cccTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGttgttg < 1:1143428/214‑1 (MQ=255) cccTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGttgttg > 4:1143468/1‑214 (MQ=255) cccTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGATTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCCTTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTcac > 1:638685/1‑301 (MQ=255) | TCCGTATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCAC > NC_000913/2982163‑2982757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |