New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2982463 | 204 (1.140) | 6 (0.030) | 6/556 | 24.0 | 3.0% | intergenic (‑281/+34) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase |
? | NC_000913 | = 2982467 | 192 (1.100) | intergenic (‑285/+30) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACG > NC_000913/2982167‑2982767 | tATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGc > 4:295108/1‑301 (MQ=255) gatggATAGTGACCATGATTTGCGGCCCGCAGAGAGTAAGACAGAAGGAAAAAATACGGGAACAACGCAAGAAGGTGTCAGGTCGGAAAAAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACGTGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTACAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATGGTACAGCAGATAAAATGCAGAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATGTCATAGCCATGATATGTAGTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCAAGc < 1:224944/297‑1 (MQ=255) aGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAgg < 4:552773/300‑1 (MQ=255) tAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGt > 2:75463/1‑300 (MQ=255) tAACCATTTTTTCCTGCCAACAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAg < 1:1268021/297‑1 (MQ=255) aaCCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAAACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCa < 1:1259608/301‑1 (MQ=255) ccTGCCAGCAGAGAGTAAGAAATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTaaga < 1:1043376/301‑1 (MQ=255) 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cagcagAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaat > 4:892578/1‑301 (MQ=255) agcagAGAGTAAGAAATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAcaatg < 1:1157983/301‑1 (MQ=255) gagagTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAAtt < 1:1053633/301‑1 (MQ=255) 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aTACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATc > 1:1232353/1‑301 (MQ=255) cGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGAATATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCAc < 1:359563/301‑1 (MQ=255) acTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACCTGTCGTTATGTGATGGATATTCCAAATATCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCAAATTTTACAGCAGTTATAATTCATAAAGATCATTAATTGATAATTAATATGTATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGAGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCAAACCGCCATCCACGGCAATgg < 1:689924/301‑1 (MQ=255) 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cccTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGttgttg < 1:1143428/214‑1 (MQ=255) cGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATTGCATTAACATTAATGTTGGGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcg > 4:535602/1‑301 (MQ=255) cGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcg > 4:1410384/1‑301 (MQ=255) | TATTGATAGTAACCATTTTTTCCTGCCAGCAGAGAGTAAGACATAGTGAAAAAATACGTGAACAACTCACGCAGGTGTCAGGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCACATAATCTGAAGCGCTGGAGGCAAGGAACACTATCGGCCCCATCAGGTCACTCGGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACG > NC_000913/2982167‑2982767 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |