| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3667761 | 90 (1.280) | 6 (0.090) | 6/546 | 8.9 | 6.6% | intergenic (‑181/+30) | gadA/yhjA | glutamate decarboxylase A, PLP‑dependent/putative cytochrome C peroxidase |
| ? | NC_000913 | = 3667775 | 82 (1.200) | intergenic (‑195/+16) | gadA/yhjA | glutamate decarboxylase A, PLP‑dependent/putative cytochrome C peroxidase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
ATCGCGCATTTCGTGCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCGTGTACACCCCGTTCAGACTGTGCAGGAAAGCTACGATATCATCCACATCCTCCTGCGGCAGCTCTTTGCCTACCTGATAGCGCAGCATCAGTTTCACCGCCCCGTCCAGCGTCGGCACGTCACCGCGATGGAAGTACGGTGCCGTTAAAGCAACGTTACGTAAACCGGGTACTTTCTGACGCAATTTATCACGCTCTTCTTTAGTCACATTCATACGACCAATATCCGCCGCCGTAATTTCCCCA > NC_000913/3667464‑3668061 | atcGCGCATTTCGTGCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCaa > 4:18946/1‑300 (MQ=255) cgcgCATTTCGTGCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACa < 4:320892/301‑1 (MQ=255) aaTTTCGTGCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGc < 2:158022/300‑1 (MQ=255) gCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCggg > 3:155856/1‑301 (MQ=255) gCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCggg > 2:149142/1‑301 (MQ=255) gCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGa > 1:181215/1‑301 (MQ=255) gggAAATCGTTTTGAATCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAAT‑AAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATc < 3:231423/300‑1 (MQ=255) cGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGAt > 2:40138/1‑301 (MQ=255) ggAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATc > 4:269359/1‑301 (MQ=255) ggAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATc < 4:20285/301‑1 (MQ=255) ggAAATCGTTTTGACTCCGCAATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCAGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATGTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGAAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATc < 3:219091/301‑1 (MQ=255) aaTCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCaa > 4:207426/1‑300 (MQ=255) aTCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAaat > 4:56483/1‑301 (MQ=255) 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cgATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTc > 3:271283/1‑274 (MQ=255) cgATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTc < 4:271287/274‑1 (MQ=255) ccTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCgt > 4:278195/1‑301 (MQ=255) 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gAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCGTGTACACCCCGTTCAGa > 1:25694/1‑300 (MQ=255) gAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCGTGTACACCCCGTTCAGAc < 4:421707/301‑1 (MQ=255) gAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATCTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCGTGTagatcggaagagcacacgtctgaactccag > 1:447/1‑272 (MQ=255) 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4:257034/301‑1 (MQ=255) | ATCGCGCATTTCGTGCAGCGGAAATCGTTTTGACTCCGCGATAGTAGAAATGGCCTTTGCGCCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCTGAGCGGAAATCCGTTAACAGCTTCTGGTCCATTTCGAACTCCTTAAATTTATTTGAAGGCAATAAAAAAGTAGGATTTATCCGCAATGGAAGCAAGGCATTACAGGCTTAATTTAAATAACAAAATCCTAAGCAGAAAAACGACTTTTTATAATATAAACATTTAACATGATAATATTAAAAACAGACTTTATTATCGTAATAAAAATCGCCCAAACATTGCTGTTCGGGCGATCAAATTAATTATTGTTTATCCTGCATATACGGCGTGTACACCCCGTTCAGACTGTGCAGGAAAGCTACGATATCATCCACATCCTCCTGCGGCAGCTCTTTGCCTACCTGATAGCGCAGCATCAGTTTCACCGCCCCGTCCAGCGTCGGCACGTCACCGCGATGGAAGTACGGTGCCGTTAAAGCAACGTTACGTAAACCGGGTACTTTCTGACGCAATTTATCACGCTCTTCTTTAGTCACATTCATACGACCAATATCCGCCGCCGTAATTTCCCCA > NC_000913/3667464‑3668061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |