| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 3953 (0.820) | 538 (0.120) | 161/226 | 16.0 | 13.7% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 3247 (0.750) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1159 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaaaaaaaa‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATAGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 2:10297671/1‑128 TGATATTAAAGTAAATATAACTGTTTTATATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCAAGTGTGAAATTTAAATTCTTATAATTGGTAAAATTTTTTGTTAGTT‑CC‑AAAA < 2:5764185/128‑1 tcggatctGTAAAGATTACTGATTTAGATATAAAAAAAATCTATTTTGCCAAATTATTAGAATAAATCAATTCATTTGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAA < 1:9442620/120‑1 ATATTAAATTAAATATTACTGATTTATATTTAAAAAAAATATATATAGAAAAATTATTATAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAAAAA < 1:3786941/128‑1 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGATATAAAAATTCTAAATATAGGTAAAATTATAAGTTATTA‑CC‑AAAAAA > 1:2526040/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTATTT‑AA‑AAAAAA > 1:4039972/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAAAAA > 1:10438750/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAA > 1:1214429/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAA > 2:8509094/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAA > 2:420356/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATAAAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTATAGTT‑CC‑AAAAAA > 1:5324208/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAA > 2:10495070/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAA > 2:8669588/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAA > 1:9495275/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTAGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAAAAAA > 1:622014/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAAGTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAA > 2:5912211/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAAATTTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAA > 1:3045672/1‑128 acTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAA > 2:8933258/3‑128 ATTAAATTAAATATCACTGATTTAGAAATAAAAAACATCTATATAGACAAATTTTTATAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTATTT‑CC‑AAAAAAAA < 2:6214278/128‑1 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAA > 1:8785232/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AAAAAAAA > 1:7001418/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAA > 2:1860701/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATAGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAA > 2:5388404/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATTTTAGTT‑AC‑AAAAAAAAAAA > 2:390452/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATATGTAAAATTATATCTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAA > 1:10294869/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAA > 2:9323294/1‑128 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA > 2:9843976/1‑128 CTGATTTAGATATAAAAAAAATCTATATATACAAATTATTAGAATAAATCAAATCATCTGTGAAATTGAAAATCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATAT < 2:6458295/128‑1 GATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTT > 1:3247670/1‑128 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑AT‑TT‑TAAAATTTTT > 1:222965/1‑128 TTATATATAAAAAACATATAAATATAAAAATTATTATAAGAAATAAATTCATCTGTGAAATTGAAATTATAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTC < 2:8813475/128‑1 ATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TT‑TAATATTTTTATTTAA > 2:8251732/1‑128 TATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTTTATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑AT‑TT‑TAAATTTTTTaatttat > 1:5872775/1‑121 TATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑AAATATTTTAATTTAA > 1:4332522/1‑128 TATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑AT‑TT‑TAATATTTTTTTATAAA > 2:3053347/1‑128 ATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAA < 2:1620335/128‑1 AAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑ATATT‑TAATATTATTATTAAATAA > 1:9737480/1‑128 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAAT > 1:7964632/1‑128 aaaataTATATAGACAAATTATTATAATAAATCAATTAATATTTTAAATTTAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTT < 2:1246305/122‑1 AACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AAAAAAAAAAAAA‑ATATGTTAATATTTTAATTTAAAAAATT > 2:5022944/1‑128 CATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TT‑AAATATTTTAATTTAAAAAATTTAaa > 1:3569913/1‑126 TATAGACAAATTATTAGAATAAATCAATTAATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATAAGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTAT < 2:2278321/128‑1 ATAGAAAAATAATTAGAATAAATAAATTAATCTGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATA < 2:9693877/128‑1 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑TT‑TT‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTAACTTTATtt > 1:9257875/1‑126 ACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAACGT‑TG‑TAATATTTTTATTTAAAAAATTTAGATTTATATAtt > 1:3421296/1‑126 ACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑TT‑TT‑AAAAATTTTTATTTAAAAAATTAATCTTTATtaaatt > 1:2742747/1‑122 TTAGAAGAAATAAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAAAATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTAATATAATGATAATTG > 2:8329010/1‑128 gtAGAAATAAATTAATTTGTTTATTTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGATAGTTACA‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAAT < 2:5198528/126‑1 gaactAATTAATTGATCTGTGAAAATGAAATTCAAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATT < 1:7761785/123‑1 AAGAAATCAATTCATCTTTTAAAATGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATT < 2:675032/128‑1 AAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TATTATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAATTTTATTTGAATT > 1:8626161/1‑128 atAAATAAAATCATATGTGAAATTGAAATTATAAATATTTGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTT < 2:7827197/126‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAA < 2:3456215/128‑1 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑TT‑TT‑TAATATTTTAATTTAAAAAATTTATATTTATATAATTTTATTTTAATTTAAt > 1:9054171/1‑127 TGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTTAATTTAAAGGGGAATTTGGt > 1:5664235/1‑127 GTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TT‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTAAATTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGGGAATTTGtttt > 2:10094947/1‑124 TGAAATTGAAATTTTAATAATTTGTAAAATTATATTTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTT < 1:4640750/128‑1 GAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGTAATTTGGGTTG > 1:4815356/1‑128 GAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTAATATGAATATAAAGGTGAATTTGGTTTG > 2:2095762/1‑128 AAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TT‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGTGTAATTTGTGTTGT > 2:4079905/1‑128 AAATTGAAATTATAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTTACA‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGT < 1:8261739/128‑1 ttaTAATAATTGTTAAAATTATATGTTATTT‑AC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTA < 2:7467780/125‑1 TTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑TT‑TT‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTAAATAATGTTAATTGAATTTAAAGGGGATTTTCTGTTGTACATTTATTA > 2:4556380/1‑128 aTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTAT < 2:4899882/127‑1 AAAATTTAATGTTAGTTACA‑AAAAAAAAAAAAA‑GG‑TG‑TAATTTTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTA < 1:9865021/128‑1 aaaTATATGTAAGTTACA‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 1:1424098/125‑1 ATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATAC > 1:600809/1‑128 TATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATTTTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGTTTGTACATTTTTTATTAATTTATATTATtatagct > 1:1634305/1‑121 tTTAGTT‑CCAAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTA < 2:9146863/127‑1 aaatAAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TTATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCA < 1:7499926/124‑1 AAAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:6498284/128‑1 AAAAAAAATATA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGTTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:7689220/128‑1 AAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTTATTTTTTTATTACATCGTTAAGTTCACTtaa > 1:2874899/1‑125 AAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:5122689/128‑1 AAAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:8489564/128‑1 AAAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:141787/128‑1 AAAATAATAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATAAATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:8101181/128‑1 AAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:2441761/128‑1 AAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:10000149/128‑1 AAAAAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:6040567/128‑1 AAAAAAAAA‑TT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:8123099/128‑1 AAAAAAAAA‑GT‑TG‑TTATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:4517227/128‑1 AAAAACA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAAATTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:1899990/128‑1 AAAAAAA‑GT‑TG‑TTATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:4326616/128‑1 AAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATGTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTTTTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA > 2:4737530/1‑128 AAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:5492998/128‑1 AAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:9478965/128‑1 AAAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:3229507/128‑1 AAAAAA‑GT‑TG‑TAATCTTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATAT < 1:6783099/128‑1 AAAAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGTTTTTACATTTATTATTAATTTTTATTATAAATCCTTATTTTCAATAATATATAT > 1:5413288/1‑128 AAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTTTTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCAAAAATATATATAA > 1:717476/1‑128 AAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 1:2073996/128‑1 AAAA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 2:3631243/128‑1 AA‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATTTAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTAAAAATCCTTAAGTTCACTAAAATATATAAAT > 1:1099466/1‑128 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTGTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGATTTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAATTACAATAATATATATAAATT > 2:6857914/1‑128 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAATAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:7167878/128‑1 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:7959405/128‑1 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:2814958/128‑1 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:7017144/128‑1 A‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT > 2:2564198/1‑119 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAAAAAAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaaaaaaaa‑GT‑TG‑TAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |