| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 2525 (0.810) | 277 (0.100) | 114/224 | 36.3 | 11.2% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 2131 (0.760) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 615 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaa‑‑a‑aaa‑a‑aaaaa‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑A > 1:569351/1‑128AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑A > 2:5882706/1‑128 tTTGATATTAAATTAAAGATCACTGATTTATATATAAAAAACATCTATATATAAAAATTATTATAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AA < 1:319036/127‑1 GTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AA > 1:3852366/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCTATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTATTTAC‑‑AAA‑‑A > 2:852652/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTAGTAAAATTATATGTTATTTCA‑‑AAA‑‑A‑A > 1:4097781/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTAC‑‑AAA‑‑A‑A > 2:3694186/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑A > 1:723352/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AA > 1:3469865/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTATAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AA > 1:1334651/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AA < 1:5877541/128‑1 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AA > 2:5568740/1‑128 ttTTAAATTAAAGATCACTTTTTTAGATATAATAAAAATATATATTGAAAAATTATTAGAAGAAATAAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATTTGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA < 2:3327567/126‑1 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATTTAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATTATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A > 2:4780205/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A > 2:2031739/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTATATTTCA‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A > 1:4710874/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A > 2:5344305/1‑128 TTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑A > 2:21711/1‑128 TTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATAGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑A > 2:3808072/1‑128 TTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATATTTGAAATTGAAATTCTAATAATTTTTAAAATTATATATTAGTTCA‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑A > 1:4826757/1‑128 TTAAAGTAAAGATCAATTATTTAGATATAAAAAACATATATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑A < 1:6116516/128‑1 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑Ata > 1:2552160/1‑126 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AA > 1:5466659/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTAC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AA > 1:6714438/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTAGTAAAATTATATGATAGTTCA‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AA > 2:1373500/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAA > 2:2620294/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAA > 2:637485/1‑128 ACTGATTTCGATATAAAAAAAATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATAT < 1:2934379/128‑1 ACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTTTAATAT > 1:5934338/1‑128 CTGATTTATATATAAAAAACATATATATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATAT < 1:1269877/128‑1 CTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑A < 1:2191162/109‑1 ATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑ATTtaaaatatttt > 1:1042078/1‑117 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTT > 1:4556503/1‑128 TTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATAATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATAGAATTTCTAATAATTGTTAAAATTATATTTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTTTAATATATTTa > 1:1755973/1‑127 TAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAATA‑AAAAATTTTGAAATATTTTTa > 2:392247/1‑127 GATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑TTTTTAATATTTTTATTTA > 1:3535282/1‑128 ATATAAAAAACATATATATATACAAATTATTATAATAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTA < 2:773809/128‑1 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑TTTTTAATATTTTTATTATAAAAAT > 1:1895966/1‑128 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTTTATTATTTTTATTTAAAAAAT > 2:5387097/1‑128 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTATTTAAAAAAT > 1:3009139/1‑128 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑‑AA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTT > 1:155605/1‑128 ATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTAATTTAAAAAATTTATa > 1:904610/1‑127 CTATATTTAAAAATTATTAATAGAAATCATTTCATCTTTTAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTT < 1:1997933/128‑1 TATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑ATAAA‑A‑AATAA‑TTTGTATTATTTTTCTATAAAAAATTTATCTTT > 1:1131156/1‑128 TATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGACATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTAT < 2:6084699/128‑1 atatatAAATTATTTGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAAATGAAATTCTAATAATTTTTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATA < 1:2497505/122‑1 ATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTCATATTTGAAATTTAAATTATAATAATTTGTAAAATTATATTTTTTTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATA < 1:5337054/128‑1 ATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAACTA‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTTAATTTTATAGTTATAAAATTTATATTTAT > 2:3587102/1‑128 ATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A < 1:4900762/82‑1 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑ATTTTAATATTTTTATTTAAAAAAATTtaaattataa > 2:1791142/1‑118 TTATAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATTTGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTG < 2:3009139/128‑1 atAAATCAATTCATATGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTTTATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTT < 2:5831225/126‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑TTTTTAAAATTTTTTTTTAAAAAATTTAAATTTA‑ATAATTTTTATTTTA‑ATTTAA > 2:6458669/1‑128 AAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTAAATGTTATTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAA < 2:6270003/128‑1 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑TTAGTAATATTTATCTTTAAAAAATTTAACTTAATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAG > 1:5184817/1‑128 TCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTTTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATTTTTATATAA‑TTTTATTTTA‑ATTTAAAGt > 2:4340279/1‑127 TCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGG < 2:4686644/128‑1 taATCTGAGATATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATT < 2:1570474/126‑1 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCAAAAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTAAAAAAATTTAACTTTATATAA‑TTTTTTTTGATATTTAtgggtattt > 2:2770577/1‑119 TGTGAATTTTTAATTATAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTTGC‑‑AAAT‑A‑AAA‑ATAATAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGG < 1:3718578/128‑1 GTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAATTTTATATTTATATAA‑TTTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGT > 1:4351985/1‑128 GAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTACTTTAAAAAATTTAGATTTAAAAAA‑TGTTATTTAA‑ATTTAAAGGGTATTTTGGGTTt > 2:6839281/1‑127 AATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTA < 2:5168240/128‑1 ATTGTAATTCTAATATTTTGTAAAAATATATGTTAGTTAC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA < 1:601326/128‑1 ttttAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTATTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA < 2:2356192/124‑1 TTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTGTTTAAAAAATTTAAATTTAAATAA‑TTTTATTTTA‑TTTAAAAGGGAATTTTGGGTTTTACAG > 1:5394751/1‑128 AATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAA‑TTTTATTTTA‑ATTTAAAGGGTAATTTGGGTagataggatg > 1:6441073/1‑118 TTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTAGTTCCT‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATT < 1:860783/128‑1 AATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGTGGATTTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATa > 1:964017/1‑127 TGGTAAAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTTTATTTATATAA‑TGTTATTTTA‑ATTTAAAGGGGAATTTTGTTTTTACAGTTATTATTATTTTGT > 1:5076574/1‑128 GGTAAAATTAAATGTTATTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TTTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTA < 2:4189880/128‑1 AAATTATATGTTAGTTCCA‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTTTAATATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAA‑TTTTATTTTA‑ATTTAAAGGGTAATTTGTTTTGTACAGTTATTATTAATTagatagga > 2:1106264/1‑120 ATGTTATTTCC‑‑AAA‑‑ATAAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCT < 1:6254139/128‑1 tttcgaatAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGT < 1:6573784/120‑1 AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:2515768/128‑1 AA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:3960143/128‑1 tA‑AAA‑T‑AATAA‑GTTGTATTATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:2662353/127‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTTAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:5752727/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:5931228/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:2440654/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:1715816/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2343010/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:6375997/128‑1 A‑AAA‑A‑AAAAA‑GGTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATATATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:5106750/128‑1 AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:4229925/128‑1 AAA‑A‑AAAAA‑GTTGTAAAATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAA‑TTTTATTTTA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTTTTAATTTGTATTATACATCATTAAGTTCACTAATATA > 2:6663114/1‑128 A‑A‑AAATA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:1459887/128‑1 A‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:5061781/128‑1 A‑A‑AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:450040/128‑1 aatatAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:2836162/123‑1 aatAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTTAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:212373/125‑1 AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGTGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATA < 1:1410271/128‑1 AAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGTTTGTACAGTTATTATTAATTTTTATAATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATA > 2:4855143/1‑128 AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 1:3274550/128‑1 AAAA‑GTTGTAATATTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 2:1270384/128‑1 AAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TTTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTAAAGTTATTTTTAATTTGTATTATAAATCATTAAGTTCACTAATATATATAAA > 1:5587534/1‑128 AA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAAT < 2:6498589/128‑1 A‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:5455990/128‑1 A‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:5766839/128‑1 A‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑AGTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:3521081/128‑1 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTCC‑‑AAA‑‑A‑AAA‑A‑AAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaa‑‑a‑aaa‑a‑aaaaa‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAA‑TGTTATTTGA‑ATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |