| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 752,861 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑66/+321) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 42 (0.850) | 36/298 | 0.7 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 752861 = | 0 (0.000) | intergenic (‑66/+324) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 689045 | NA (NA) | 62 (1.250) | 55/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 752864 | 0 (0.000) | intergenic (‑69/+321) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAA‑TATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGC > NC_000913/752711‑752998 | ctaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccc > 1:169133‑M2/151‑151 (MQ=255) taaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCt > 2:671642‑M2/150‑151 (MQ=255) aaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCta < 1:265698‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCta < 1:247085‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtag < 2:645050‑M2/4‑1 (MQ=255) aaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCt < 1:424534‑M2/2‑1 (MQ=255) aaCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtag < 2:425011/151‑1 (MQ=255) aaCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCt > 1:434764/1‑149 (MQ=255) 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aCAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatca > 2:500267‑M2/1‑118 (MQ=255) gagaTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttg > 2:724877‑M2/1‑112 (MQ=255) gagaTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttg < 2:171959‑M2/151‑40 (MQ=255) aaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAA‑TATTGTTAGTTTTATTAAAt < 2:474661‑M2/44‑1 (MQ=255) gaTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtc < 1:639407‑M2/151‑42 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |