| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 752,861 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑66/+321) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 689045 | NA (NA) | 62 (1.250) | 55/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 752864 | 0 (0.000) | intergenic (‑69/+321) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAA‑TATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTT > NC_000913/752714‑753014 | aaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtag < 2:645050‑M2/4‑1 (MQ=255)aaCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtag < 2:425011/151‑1 (MQ=255) tggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtagttttt > 1:166616‑M2/143‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |