| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,187,816 | Δ15 bp | coding (2467‑2481/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4187816 | 4187830 | 15 | 38 [0] | [0] 39 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4187815 | 0 (0.000) | 38 (0.750) | 37/296 | 0.6 | 100% | coding (2466/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4187831 = | 0 (0.000) | coding (2482/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
GCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTG > NC_000913/4187684‑4187978 | atctccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgggtg > 1:453635‑M2/148‑151 (MQ=255) ccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgggtgg < 2:160457‑M2/5‑1 (MQ=255) ccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGgtggtg < 2:101266‑M2/7‑1 (MQ=255) gctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGc > 2:140988‑M2/133‑151 (MQ=255) ggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGcgcg > 1:67859‑M2/124‑151 (MQ=255) ctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATc > 1:197447‑M2/121‑151 (MQ=255) ggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTa < 2:50982‑M2/36‑1 (MQ=255) ataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACt < 1:682243‑M2/38‑1 (MQ=255) accgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTgg < 1:180818‑M2/40‑1 (MQ=255) gaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCgtgt > 2:734642‑M2/104‑150 (MQ=255) gaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCgtgt < 1:27911‑M2/47‑1 (MQ=255) tgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAActgct > 1:505648‑M2/98‑151 (MQ=255) gcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAActgct < 2:259162‑M2/54‑1 (MQ=255) gaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattttggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCCGaa < 1:774306‑M2/57‑1 (MQ=255) cggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGtt > 2:106569‑M2/89‑151 (MQ=255) gttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCt < 1:86798‑M2/65‑1 (MQ=255) gtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTAc > 2:740405‑M2/75‑151 (MQ=255) cgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTAct < 2:634747‑M2/78‑1 (MQ=255) 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tacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCCGCGCGATCGCGTAATGGGTCGAGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCAGGGTACAGATGATATACTCGTTCCGCGCAACACGCTGTTGCACGAACAGAGGggtg > 1:748612‑M2/23‑149 (MQ=255) atgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACctgct < 2:61494‑M2/134‑1 (MQ=255) atgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACctgct > 2:203146‑M2/18‑151 (MQ=255) tgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACctgctg > 1:562817‑M2/17‑151 (MQ=255) ggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGa > 2:392738‑M2/13‑149 (MQ=255) ggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAag < 2:552942‑M2/139‑1 (MQ=255) atcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAagag < 2:449451‑M2/141‑1 (MQ=255) catgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAAc < 2:581812‑M2/144‑1 (MQ=255) atgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAAct > 1:310659‑M2/7‑151 (MQ=255) atgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTg > 2:427265‑M2/4‑151 (MQ=255) ggtggtGAAGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAActct < 2:217302/147‑1 (MQ=255) | GCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTG > NC_000913/4187684‑4187978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |