| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3399212 | 101 (1.160) | coding (767/1104 nt) | mreC | cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
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CGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGAT < 1:918648/151‑1 CGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGAT < 2:329225/151‑1 CGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGAT < 2:729341/151‑1 CAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGC > 2:1034543/1‑151 CGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGAT < 1:254960/151‑1 GCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCC > 1:368273/1‑151 CCGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCG < 2:418276/151‑1 CGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGC > 1:229283/1‑151 CGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGC > 2:824500/1‑151 ACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGT > 2:430325/1‑151 CGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTA < 1:1258297/151‑1 CGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGT > 1:174953/1‑150 AGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCC > 2:907444/1‑151 GAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCT < 1:947543/151‑1 GCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCC > 1:1009913/1‑150 GCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGC > 1:514246/1‑149 GTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAG < 2:1269513/150‑1 GTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCC > 1:20947/1‑148 GTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCC > 2:141896/1‑148 GTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCC > 2:405581/1‑148 CCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGAC < 1:885157/150‑1 GTGGGATGATAACCCGGCGCAGTTCGTGATTAACGCAATGGCACCGGCAGACGTTGCTTCTATCGTGGTGGATGAAGATAAACACACCATGGATATCGCCGTTGAAGCCGGTAACCTGGCGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3316702‑3316548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgtcCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGAC < NC_000913/3399212‑3399064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |