| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 701,614 | IS1 (+) +9 bp | coding (1130‑1138/1149 nt) | nagA ← | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 701614 = | 0 (0.000) | coding (1138/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 64 (0.940) | 54/298 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 701622 | 0 (0.000) | coding (1130/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TTGCTCGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGTAGCACTTCATCCAGTG > NC_000913/701472‑701772 | gcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGt < 1:379530‑M2/9‑1 (MQ=255) cGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtga > 1:481055‑M2/1‑146 (MQ=255) ataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCg > 1:991880‑M2/138‑151 (MQ=255) ggCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgat > 1:722427‑M2/1‑145 (MQ=255) aacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGtt > 1:522259‑M2/136‑151 (MQ=255) cctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTa > 1:31310‑M2/134‑150 (MQ=255) tgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACg > 1:162863‑M2/132‑151 (MQ=255) gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAAc < 1:899035‑M2/19‑1 (MQ=255) gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgagcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAAc < 1:172153‑M2/19‑1 (MQ=255) gaatctgaggcagaacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACg > 2:561322‑M2/131‑150 (MQ=255) aatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGa > 1:576180‑M2/130‑150 (MQ=255) atctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGATg > 1:527874‑M2/129‑151 (MQ=255) cgcgAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttac > 2:713133‑M2/1‑132 (MQ=255) 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aTTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCAATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatt > 2:883377‑M2/1‑126 (MQ=255) tGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgattta > 1:149402‑M2/1‑124 (MQ=255) tGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgattt < 1:901775‑M2/149‑26 (MQ=255) tGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgattt < 2:263536‑M2/149‑26 (MQ=255) gCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtg < 2:1032440‑M2/151‑30 (MQ=255) 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ttcattaccagACCTCGTTACCTGTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTGAGGTTGGATACTGTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGGCACTCGCACGCGCCGGATATAGCTTCGCCATa < 2:782036/139‑1 (MQ=255) aTTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgc > 2:376948‑M2/1‑18 (MQ=255) cattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGt > 1:820856‑M2/8‑150 (MQ=255) gAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggac > 2:423759‑M2/1‑15 (MQ=255) aGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatc < 2:1051888‑M2/151‑138 (MQ=255) 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gtggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctct < 1:333959‑M2/151‑150 (MQ=255) tggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctg < 1:642241‑M2/151‑151 (MQ=255) | TTGCTCGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGTAGCACTTCATCCAGTG > NC_000913/701472‑701772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |