Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,810,987 | IS1 (–) +9 bp | coding (218‑226/531 nt) | mprA → | transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2810987 = | 0 (0.000) | 89 (1.220) | 76/296 | 0.0 | 100% | coding (218/531 nt) | mprA | transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux |
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* | ? | NC_000913 | = 2810995 | 0 (0.000) | 79 (1.080) | 67/298 | 0.1 | 100% | coding (226/531 nt) | mprA | transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux |
? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
CGTGACCTTTTTCCGTTAATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2811136‑2810987 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGC > NC_000913/3583428‑3583578 CGTGACCTTTTTCCGTTAATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTG < 1:1046803/151‑1 CGTGACCTTTTTCCGTTAATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTG < 1:97553/151‑1 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2:182324/151‑1 AATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTT > 2:886067/1‑150 AATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTT < 2:1055752/150‑1 AATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTT < 1:667336/150‑1 TTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:764229/1‑151 TGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1099884/150‑1 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2:46924/150‑1 AGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 2:901180/1‑151 CAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:970783/151‑1 AGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:117028/151‑1 AGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:993676/1‑150 GGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:486232/1‑151 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ACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 1:747498/1‑150 CCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 2:163628/1‑151 CCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1113730/151‑1 CGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 2:1126626/1‑151 CGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 2:485013/1‑151 GCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 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CCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 2:666678/1‑151 CAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTGAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT < 1:761628/151‑1 GTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:1061503/1‑151 TCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 2:438035/1‑151 CATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 1:1031382/1‑151 CATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT < 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ACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG > 1:690665/1‑151 TGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTG > 2:964380/1‑151 TACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT > 1:344261/1‑151 ATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA < 1:4971/151‑1 ATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAA > 2:789565/1‑150 ATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAA > 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CAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 1:751435/1‑151 CAACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG < 2:1128995/151‑1 AACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGA < 2:99270/151‑1 ACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC < 2:71692/151‑1 ACTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > 2:993247/1‑151 CTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > 1:462696/1‑150 CTTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > 2:968100/1‑150 TTAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 2:255543/1‑151 TAATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACA < 1:224555/149‑1 AATTCAGAAGGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCA < 2:299940/151‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG > 2:485177/1‑151 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG > 2:159268/1‑151 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGC < 1:805726/151‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < 1:437779/149‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCT < 1:963697/149‑1 CGTGACCTTTTTCCGTTAATTGCAGATGCAGGCAGCGGCGATCGTTATCGCTTTCACGACGTTCGATCCAACCGCGTTTTTCCAGTTCATCGGCAATACGCGTCGCGTTGGTACGGGATGATCCAAGAGCACAACTTAATTCAGAAGGCTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2811136‑2810987 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGC > NC_000913/3583428‑3583578 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |