| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 691,774 | Δ12 bp | [ybeX] | [ybeX] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 691774 | 691785 | 12 | 72 [0] | [1] 73 | [ybeX] | [ybeX] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 691773 | 0 (0.000) | 66 (0.870) | 59/294 | 0.4 | 100% | coding (12/879 nt) | ybeX | putative ion transport |
| ? | NC_000913 | 691786 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+88) | ybeX/ybeY | putative ion transport/ssRNA‑specific endoribonuclease; 16S rRNA 3' end maturation and quality control co‑endoribonuclease working with RNase R; rRNA transcription antitermination factor | |||||
CGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCAT > NC_000913/691623‑691921 | cgTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTG < 2:1190798‑M1/151‑1 (MQ=255) gTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGg > 2:697568‑M1/1‑150 (MQ=255) cgATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgg < 2:880441‑M1/151‑12 (MQ=255) cgATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgg > 2:142209‑M1/1‑140 (MQ=255) cgATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtat > 1:948117‑M1/1‑140 (MQ=255) gATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTCTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatggg > 2:675665‑M1/1‑139 (MQ=255) aTAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggt > 2:364722‑M1/1‑138 (MQ=255) cGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcat < 1:1155443‑M1/150‑20 (MQ=255) gTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgt > 1:239877‑M1/1‑130 (MQ=255) cGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaat < 2:1176620‑M1/151‑30 (MQ=255) gAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatc > 2:89831‑M1/1‑120 (MQ=255) cACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaac > 1:1042510‑M1/1‑116 (MQ=255) cACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaac > 2:880714‑M1/1‑116 (MQ=255) cACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaa < 1:55146‑M1/150‑35 (MQ=255) cGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgc < 2:947344‑M1/151‑38 (MQ=255) cAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcg > 1:15949‑M1/1‑109 (MQ=255) aGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgt > 1:1090509‑M1/1‑108 (MQ=255) gcgcCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgtt < 1:1139331‑M1/151‑45 (MQ=255) gcgcCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgtt < 1:774843‑M1/151‑45 (MQ=255) gcCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgtta > 2:547526‑M1/1‑105 (MQ=255) cagcagTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatc < 1:23201‑M1/151‑49 (MQ=255) agTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcacc > 2:1044834‑M1/1‑99 (MQ=255) cGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGCGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacgg > 2:1109751‑M1/1‑95 (MQ=255) cACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgg < 1:976326‑M1/151‑60 (MQ=255) aCGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGTAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcggcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgctgtcgttaatcaccaacggcggg > 1:1030363‑M1/1‑91 (MQ=255) aCGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggg < 2:93376‑M1/151‑61 (MQ=255) gTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgggg > 2:162373‑M1/1‑88 (MQ=255) gTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggg > 1:451803‑M1/1‑88 (MQ=255) tttttCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgggggcg > 1:20272‑M1/1‑87 (MQ=255) tttCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgggggc > 2:330237‑M1/1‑85 (MQ=255) cGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtc < 1:577481‑M1/148‑67 (MQ=255) gTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgcca < 2:1056809‑M1/151‑72 (MQ=255) ttCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacggctggc > 2:748845‑M1/1‑79 (MQ=255) 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tGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgggggcggcttcccgtcaaaagcccggcaaaat > 1:724266‑M1/1‑59 (MQ=255) gAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaatta < 1:134841‑M1/149‑92 (MQ=255) aGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcgggggggcgtgctaatcaaaagccttgcaaa > 1:67313‑M1/1‑57 (MQ=255) cAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttct < 2:280251‑M1/151‑100 (MQ=255) cAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttct < 1:461471‑M1/151‑100 (MQ=255) 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gttgCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgcccgtcaaaaacctggaacatttttttttctcggcaatgtacgggtactc > 2:148173‑M1/1‑31 (MQ=255) ttgCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggaggtccgccactcaaatgcctggccaattattctttctcggcaatgtacgggtcctc > 2:641738‑M1/1‑30 (MQ=255) tgCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattttttttcggcaatgtacggatcctcata > 1:448721‑M1/1‑29 (MQ=255) gCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatag < 2:1081023‑M1/150‑123 (MQ=255) gCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatag < 2:645198‑M1/150‑123 (MQ=255) cTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaaagcctggcaaattattctttttcggcaatgtacggatcctcatagcc > 2:1134530‑M1/1‑27 (MQ=255) gtgtCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacggctgtccggccaatgcctggcaaattattttttctcgggaatgtacggatcctcattaccc > 1:1084327‑M1/1‑21 (MQ=255) gtCACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgtttatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagca < 1:588313‑M1/150‑132 (MQ=255) cACTACTGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacggctgccagtcaaaagcctggcaaattattctttttcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaa > 2:298009‑M1/1‑17 (MQ=255) actGTGTGAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataa < 1:287577‑M1/151‑139 (MQ=255) tgtgAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtcttcccgtcaaaagcccggcaaaatattctttctccgcaatgtacggatccccatagcccagaggcaacgtaa > 1:1067482‑M1/1‑9 (MQ=255) gtgAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctct < 1:547513‑M1/151‑144 (MQ=255) gAATTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctg < 2:479672‑M1/150‑145 (MQ=255) aaTTGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacggctgccagtcaaaagcctggcaaattattttttctcggcaaattacggatcctcatagcccagagcaagcaaaatctctgtt > 2:724524‑M1/1‑5 (MQ=255) tGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctgtttc < 1:675642‑M1/150‑149 (MQ=255) tGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctgtttc < 2:5607‑M1/150‑149 (MQ=255) tGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctgtttc < 2:497888‑M1/150‑149 (MQ=255) tGgcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctgtttc < 1:1109627‑M1/150‑149 (MQ=255) ggcgtcgtatgggttctcatgttagttaatcaaaacgccgtcgttaatcaccaacggcggggacgtctgccagtcaaatgcctggcaaattattctttctcggcaatgtacggatcctcatagcccagagcaagcataatctctgtttc < 1:662997‑M1/149‑149 (MQ=255) | CGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCAT > NC_000913/691623‑691921 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |