| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 691,774 | Δ12 bp | [ybeX] | [ybeX] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 691774 | 691785 | 12 | 72 [0] | [1] 73 | [ybeX] | [ybeX] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 691773 | 0 (0.000) | 66 (0.870) | 59/294 | 0.4 | 100% | coding (12/879 nt) | ybeX | putative ion transport |
| ? | NC_000913 | 691786 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+88) | ybeX/ybeY | putative ion transport/ssRNA‑specific endoribonuclease; 16S rRNA 3' end maturation and quality control co‑endoribonuclease working with RNase R; rRNA transcription antitermination factor | |||||
ATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTC > NC_000913/691636‑691933 | gtatcttcgtcgataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgg > 2:697568‑M2/151‑151 (MQ=255) cgataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTAt > 1:948117‑M2/141‑149 (MQ=255) cgataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATgg < 2:880441‑M2/11‑1 (MQ=255) cgataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATgg > 2:142209‑M2/141‑151 (MQ=255) gataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtctcactactgtgtgaattgGCGTCGTATggg > 2:675665‑M2/140‑151 (MQ=255) ataaggtcgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGt > 2:364722‑M2/139‑151 (MQ=255) cgttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCAt < 1:1155443‑M2/19‑1 (MQ=255) gttctgcccggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATgt > 1:239877‑M2/131‑151 (MQ=255) cggaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAAt < 2:1176620‑M2/29‑1 (MQ=255) gaatcacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATc > 2:89831‑M2/121‑150 (MQ=255) cacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCaaaa < 1:55146‑M2/34‑1 (MQ=255) cacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAAc > 2:880714‑M2/117‑151 (MQ=255) cacggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAAc > 1:1042510‑M2/117‑151 (MQ=255) cggatcagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGc < 2:947344‑M2/37‑1 (MQ=255) cagcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCcgtcg > 1:15949‑M2/110‑151 (MQ=255) agcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCcgtcgt > 1:1090509‑M2/109‑151 (MQ=255) gcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGtt < 1:1139331‑M2/44‑1 (MQ=255) gcgccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGtt < 1:774843‑M2/44‑1 (MQ=255) gccagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTa > 2:547526‑M2/106‑150 (MQ=255) cagcagttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATc < 1:23201‑M2/48‑1 (MQ=255) agttcgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCAcc > 2:1044834‑M2/100‑150 (MQ=255) cgtcacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgcgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAAcgg > 2:1109751‑M2/96‑151 (MQ=255) cacggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAAcggcgg < 1:976326‑M2/59‑1 (MQ=255) acggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacaggtagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGGCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCTGTCGTTAATCACCAACGGCggg > 1:1030363‑M2/92‑151 (MQ=255) acggtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCggg < 2:93376‑M2/60‑1 (MQ=255) gtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCgggg > 2:162373‑M2/89‑149 (MQ=255) gtttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCggg > 1:451803‑M2/89‑148 (MQ=255) tttttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGGCg > 1:20272‑M2/88‑151 (MQ=255) tttcggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGgcgggggc > 2:330237‑M2/86‑146 (MQ=255) cggttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTc < 1:577481‑M2/66‑1 (MQ=255) gttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCa < 2:1056809‑M2/71‑1 (MQ=255) ttcaccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGGctggc > 2:748845‑M2/80‑147 (MQ=255) caccgtggaaaagttggctgagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGt < 1:1087097‑M2/73‑1 (MQ=255) 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gagtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAatta < 1:134841‑M2/91‑1 (MQ=255) agtaacagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGGGGCGTGCTAATCAAAAGCCTTGCaaa > 1:67313‑M2/58‑145 (MQ=255) cagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTAttctttct < 2:280251‑M2/99‑1 (MQ=255) cagggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTAttctttct < 1:461471‑M2/99‑1 (MQ=255) agggagaaaaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTtctc < 2:14041‑M2/100‑1 (MQ=255) 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aaatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGGCGTCTGCCAGTCAAAAGCCTGGCAAATTATTTTTTCTCggcca > 1:223281‑M2/44‑146 (MQ=255) aatcccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAAAGCCTTGCAAAATATTTTTTCTCCGCaa > 1:1022339‑M2/43‑147 (MQ=255) cccttcttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCCGTCAAATGCCTGGCCAATTATTTTTTCTCGGCAATGTACgg > 1:1046662‑M2/40‑151 (MQ=255) cttgttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGGGGGCTGCCAGACAAAAGCCTGGCCAATTATTCTTTTTCGACAATGTGCGGATcc > 2:962081‑M2/35‑150 (MQ=255) gttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCCGTCAAAAACCTGGAACATTTTTTTTTCTCGGCAATGTACGGGTACTc > 2:148173‑M2/32‑149 (MQ=255) ttgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGAGGTCCGCCACTCAAATGCCTGGCCAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGGTCCTc > 2:641738‑M2/31‑148 (MQ=255) tgcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTTTTTTTCGGCAATGTACGGATCCTCATa > 1:448721‑M2/30‑150 (MQ=255) gcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAg < 2:645198‑M2/122‑1 (MQ=255) gcttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAg < 2:1081023‑M2/122‑1 (MQ=255) cttatcgtgtcactactgtgtgaattgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAAAGCCTGGCAAATTATTCTTTTTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGcc > 2:1134530‑M2/28‑151 (MQ=255) 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tgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTc < 2:497888‑M2/148‑1 (MQ=255) tgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTc < 1:675642‑M2/148‑1 (MQ=255) tgGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTc < 1:1109627‑M2/148‑1 (MQ=255) gGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTc < 1:662997‑M2/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGGCGGCTGCCAGTCAAAAGCCTGGCAAATTATTCTTTTTCGGCAATGTACGGAACCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGttt > 2:8016/1‑147 (MQ=255) | ATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTC > NC_000913/691636‑691933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |