| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,744,016 | Δ757 bp | coding (560‑1316/1374 nt) | mdtK → | multidrug efflux system transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1744016 | 1744772 | 757 | 96 [0] | [0] 96 | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1744015 | 0 (0.000) | 95 (1.180) | 80/296 | 0.0 | 100% | coding (559/1374 nt) | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| ? | NC_000913 | 1744773 = | 0 (0.000) | coding (1317/1374 nt) | mdtK | multidrug efflux system transporter | |||||
TACCTTTACGGCTTACTGGGTGCTGGGCTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCCAGCAGGCTTCTGGATAGGCTTTATTATTGGCCTGACGTCGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAATTTC > NC_000913/1744626‑1744922 | cgccgggatatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATg < 1:543888‑M2/4‑1 (MQ=255) gccgggatatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGc < 1:833710‑M2/5‑1 (MQ=255) gccgggatatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggcgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGc > 2:499263‑M2/147‑151 (MQ=255) ccgggatatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCg < 1:1261702‑M2/6‑1 (MQ=255) atatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTcc < 2:247397‑M2/11‑1 (MQ=255) tatctgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCt > 1:1097219‑M2/140‑151 (MQ=255) tgttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCa > 2:1038211‑M2/136‑150 (MQ=255) gttcttccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAAc < 2:730307‑M2/17‑1 (MQ=255) ccaggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGc < 1:1037034‑M2/23‑1 (MQ=255) caggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGcc > 2:1116584‑M2/128‑151 (MQ=255) aggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCg > 2:442863‑M2/127‑151 (MQ=255) aggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCg < 1:794042‑M2/25‑1 (MQ=255) aggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCg < 1:731894‑M2/25‑1 (MQ=255) ggttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGt < 1:460372‑M2/26‑1 (MQ=255) ttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTc > 2:525912‑M2/124‑150 (MQ=255) ttgcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTc > 2:375486‑M2/124‑150 (MQ=255) gcccgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGc < 1:1185028‑M2/30‑1 (MQ=255) cgtaaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCcat > 1:256768‑M2/119‑151 (MQ=255) taaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCcatc > 1:317912‑M2/117‑150 (MQ=255) aaccagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCcatcat < 2:204032‑M2/36‑1 (MQ=255) acgagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagcagggcatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt > 2:1168961‑M2/115‑151 (MQ=255) accagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt > 1:224265‑M2/115‑151 (MQ=255) accagtgtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt > 2:776535‑M2/115‑151 (MQ=255) gtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCaa < 2:1013993‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgaaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCa > 1:839664‑M2/109‑150 (MQ=255) aaggtctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGa < 1:213452‑M2/46‑1 (MQ=255) ctggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATc > 1:1172072‑M2/101‑151 (MQ=255) tggcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATcc > 1:1209167‑M2/100‑151 (MQ=255) gcaaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCg > 1:57826‑M2/98‑151 (MQ=255) caaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGc > 2:1195306‑M2/97‑151 (MQ=255) caaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGc < 2:1232055‑M2/55‑1 (MQ=255) aaaaaccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCt < 2:279685‑M2/56‑1 (MQ=255) ccaagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCtaataa < 1:360016‑M2/61‑1 (MQ=255) caagccgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCtaataa > 1:13099‑M2/90‑150 (MQ=255) cgggtatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACa > 1:985508‑M2/85‑150 (MQ=255) tatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGgcg > 2:699941‑M2/81‑151 (MQ=255) tatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGgcg > 2:390334‑M2/81‑151 (MQ=255) tatggtaatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGgcg > 2:457554‑M2/81‑151 (MQ=255) aatgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAAcc < 2:410267‑M2/76‑1 (MQ=255) atgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCtt < 1:417570‑M2/78‑1 (MQ=255) tgggctttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTc > 1:804073‑M2/73‑151 (MQ=255) tttatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACggg > 1:878993‑M2/68‑151 (MQ=255) tatcggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGtt > 1:1166667‑M2/66‑151 (MQ=255) ggcctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTgcgc > 2:411601‑M2/62‑151 (MQ=255) cctgctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCATCGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCt < 2:650331‑M2/92‑1 (MQ=255) gctggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGt > 1:1204211‑M2/57‑150 (MQ=255) tggtgaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTg < 2:55449‑M2/93‑1 (MQ=255) gaacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTAttttt > 1:916191‑M2/51‑150 (MQ=255) aacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTAc > 1:1050250‑M2/50‑151 (MQ=255) aacatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTAc < 1:495556‑M2/102‑1 (MQ=255) acatcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACg < 2:409389‑M2/103‑1 (MQ=255) atcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCa < 1:113692‑M2/105‑1 (MQ=255) tcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGc > 2:724492‑M2/46‑149 (MQ=255) tcccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCa < 1:202888‑M2/105‑1 (MQ=255) cccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAgg < 2:700668‑M2/107‑1 (MQ=255) cccggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAgg < 2:138034‑M2/107‑1 (MQ=255) cggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCt > 2:1255558‑M2/43‑151 (MQ=255) ggtgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGCGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTg > 2:1202178‑M2/42‑151 (MQ=255) tgaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTgg > 2:70752‑M2/40‑150 (MQ=255) gaactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGa < 2:865936‑M2/112‑1 (MQ=255) aactatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGc > 2:889426‑M2/38‑151 (MQ=255) actatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCg < 1:831358‑M2/115‑1 (MQ=255) ctatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGc > 2:1265588‑M2/36‑149 (MQ=255) ctatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCg > 2:1114459‑M2/36‑150 (MQ=255) tatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGtt > 1:147552‑M2/35‑151 (MQ=255) tatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGtt > 2:31824‑M2/35‑151 (MQ=255) tatatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGtt > 1:661184‑M2/35‑151 (MQ=255) atatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTg > 2:554358‑M2/34‑151 (MQ=255) atatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTg > 1:762088‑M2/34‑151 (MQ=255) atatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTg < 1:1067287‑M2/118‑1 (MQ=255) tatctttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTgc > 1:944196‑M2/33‑151 (MQ=255) tttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTATGCAGGCTGGAGCGTTGCGcc > 2:45213‑M2/29‑150 (MQ=255) ttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTgcg < 1:515720‑M2/120‑1 (MQ=255) ttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCa > 1:676059‑M2/28‑150 (MQ=255) ttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCa < 2:1037387‑M2/123‑1 (MQ=255) ttatttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCa > 2:1149995‑M2/28‑150 (MQ=255) tttatggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATcc > 2:539137‑M2/25‑151 (MQ=255) atggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGt > 1:875978‑M2/22‑151 (MQ=255) ggtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCt < 2:1164045‑M2/132‑1 (MQ=255) gtcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCtt > 2:370774‑M2/19‑151 (MQ=255) tcatttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTc > 2:1081986‑M2/18‑151 (MQ=255) catttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCg > 2:940146‑M2/17‑151 (MQ=255) catttcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCg < 1:137658‑M2/135‑1 (MQ=255) tcggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTc < 1:1254729‑M2/137‑1 (MQ=255) cggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTgg < 1:285862‑M2/140‑1 (MQ=255) ggtatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCTGTCTTCGTCTGGc > 1:911472‑M2/11‑151 (MQ=255) tatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAACGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTg > 2:914049‑M2/9‑151 (MQ=255) tatgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTg > 2:1255852‑M2/9‑151 (MQ=255) tgcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGt > 2:288165‑M2/7‑150 (MQ=255) gcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTa > 1:843072‑M2/6‑150 (MQ=255) gcctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTa > 1:355211‑M2/6‑150 (MQ=255) cctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAAt > 2:700977‑M2/5‑151 (MQ=255) cctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAAt < 2:1162251‑M2/147‑1 (MQ=255) ctgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAAtt > 1:749700‑M2/4‑151 (MQ=255) tgTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAAttt > 1:73983‑M2/3‑151 (MQ=255) gTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAATTTc > 1:178064‑M2/2‑151 (MQ=255) | TACCTTTACGGCTTACTGGGTGCTGGGCTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCCAGCAGGCTTCTGGATAGGCTTTATTATTGGCCTGACGTCGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATTCTGCAACGAGCATCCCGCTAATAAAGACAAGGCGCAACCTTCACGGGTTGCGCCTGTATTTTTACGCAGGCTGGAGCGTTGCGCCAATCCCGTCTTCGTCTGGCTGTAATTTC > NC_000913/1744626‑1744922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |