| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 771,258 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (+647/‑197) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 54 (0.820) | 50/298 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 771258 = | 0 (0.000) | intergenic (+647/‑200) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I | |||||
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GATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTA > NC_000913/771112‑771411 | gATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGg < 2:403314‑M2/151‑2 (MQ=255) gacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGa < 2:75284‑M2/6‑1 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGAttt > 2:952231‑M2/143‑151 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGAttt > 1:302258‑M2/143‑151 (MQ=255) agaacatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattaactgtcggcgatggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGAtttt > 1:492955‑M2/142‑151 (MQ=255) aTCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGggaaggt > 2:1013384‑M2/1‑143 (MQ=255) aaTGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGggaaggtgcg < 1:685200‑M2/150‑11 (MQ=255) aaTGTATAAGTCTTGGAAAGGAGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTTGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGggaaggtgcga > 2:73524‑M2/1‑140 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |