| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 771,258 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (+647/‑197) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 54 (0.820) | 50/298 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 771258 = | 0 (0.000) | intergenic (+647/‑200) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTT > NC_000913/771110‑771407 | ttgccatTTATCACTGTCTAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATTAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGCAATTTCGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGt > 1:38555/6‑149 (MQ=255) gATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGg < 2:403314‑M2/151‑2 (MQ=255) gATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGg < 1:275473‑M2/151‑2 (MQ=255) 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aTTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttc < 2:387259‑M2/151‑51 (MQ=255) tgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACAt > 2:391576‑M2/97‑151 (MQ=255) gtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATg > 1:168325‑M2/96‑151 (MQ=255) ggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGttt > 2:12696‑M2/93‑151 (MQ=255) ggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGttt < 2:744001‑M2/59‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |