| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,469,636 | IS5 (+) +4 bp | coding (506‑509/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2102943 | NA (NA) | 91 (1.130) | 75/296 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 70 (0.860) | 60/298 | 0.6 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2469636 = | 0 (0.000) | coding (506/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |