| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,469,647 | IS5 (+) +4 bp | coding (517‑520/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2102943 | NA (NA) | 67 (1.060) | 58/298 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2469650 | 0 (0.000) | coding (520/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 54 (0.850) | 48/298 | 0.6 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2469647 = | 0 (0.000) | coding (517/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CATTCTTTATTTTAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGC > NC_000913/2469504‑2469798 | cATTCTTTATTTTAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaa > 2:794972‑M2/1‑147 (MQ=255) tCTTTATTTTAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaagg > 2:742869‑M2/1‑144 (MQ=255) tATTTTAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcg < 2:663581‑M2/150‑11 (MQ=255) ttttAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaac < 2:207718‑M2/151‑14 (MQ=255) ttAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaaca > 2:746845‑M2/1‑136 (MQ=255) gccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCtaa < 2:215433‑M2/19‑1 (MQ=255) tAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaa > 2:888004‑M2/1‑135 (MQ=255) aGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagt < 1:354600‑M2/151‑18 (MQ=255) gCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtc > 2:312657‑M2/1‑133 (MQ=255) ttttCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccc < 2:529572‑M2/151‑21 (MQ=255) ctttcTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccc < 1:607978‑M2/150‑21 (MQ=255) ggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTa < 1:680910‑M2/28‑1 (MQ=255) ttATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgat < 1:204240‑M2/150‑25 (MQ=255) tATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgat > 2:13684‑M2/1‑125 (MQ=255) tATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctga > 1:558389‑M2/1‑125 (MQ=255) gaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTa < 2:628707‑M2/34‑1 (MQ=255) aaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTa > 2:28415‑M2/117‑150 (MQ=255) tcttcATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatc > 1:496821‑M2/1‑118 (MQ=255) tcttcATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatc > 2:385456‑M2/1‑118 (MQ=255) acggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 2:196137‑M2/37‑1 (MQ=255) acggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 1:1040412‑M2/37‑1 (MQ=255) cttcATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcat < 2:1039430‑M2/151‑35 (MQ=255) ttcATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatg < 1:422001‑M2/151‑36 (MQ=255) ttcATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatg < 2:139177‑M2/151‑36 (MQ=255) catcaACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtt > 2:138463‑M2/1‑114 (MQ=255) atcaACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgttt > 2:385700‑M2/1‑113 (MQ=255) atcaACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgttt < 2:454602‑M2/151‑39 (MQ=255) aaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCa < 2:865651‑M2/41‑1 (MQ=255) aaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAtt > 1:640414‑M2/108‑151 (MQ=255) aataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 1:293821‑M2/107‑151 (MQ=255) taggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat > 1:558332‑M2/105‑151 (MQ=255) aggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcactttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat < 2:389221‑M2/47‑1 (MQ=255) acTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatc > 1:663774‑M2/1‑107 (MQ=255) gTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatct > 2:232465‑M2/1‑104 (MQ=255) gTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatct > 1:924621‑M2/1‑104 (MQ=255) tgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTa > 1:194501‑M2/100‑150 (MQ=255) aTGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagca > 1:976128‑M2/1‑100 (MQ=255) caaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcccc < 2:602124‑M2/56‑1 (MQ=255) aaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCAc > 1:1016713‑M2/94‑151 (MQ=255) aggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 1:218242‑M2/59‑1 (MQ=255) gcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTaa < 1:45553‑M2/61‑1 (MQ=255) catttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAAt < 1:708161‑M2/62‑1 (MQ=255) atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacaggg < 2:670154‑M2/151‑63 (MQ=255) acgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtgt > 2:795651‑M2/85‑151 (MQ=255) gggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAt > 1:729231‑M2/83‑151 (MQ=255) ggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt > 2:725535‑M2/82‑151 (MQ=255) gagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcacctttcCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc < 1:981874‑M2/71‑1 (MQ=255) aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcat > 2:776045‑M2/1‑84 (MQ=255) aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttc > 2:1036079‑M2/1‑84 (MQ=255) agaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc > 1:546086‑M2/80‑150 (MQ=255) aaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatat > 2:739224‑M2/77‑151 (MQ=255) aaaacggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta < 2:585672‑M2/77‑1 (MQ=255) cAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtc < 2:789190‑M2/151‑76 (MQ=255) aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtc < 2:413890‑M2/150‑76 (MQ=255) ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaactta > 2:873744‑M2/1‑67 (MQ=255) ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaactt > 1:141309‑M2/1‑67 (MQ=255) tttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttacctt > 2:19624‑M2/1‑62 (MQ=255) gaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGa < 2:440755‑M2/93‑1 (MQ=255) tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcg > 2:421889‑M2/1‑60 (MQ=255) agaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca < 1:29265‑M2/95‑1 (MQ=255) agaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca < 2:1020217‑M2/95‑1 (MQ=255) cATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgac < 1:214974‑M2/149‑96 (MQ=255) ttttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtg < 2:308381‑M2/150‑100 (MQ=255) ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaat < 1:519082‑M2/151‑103 (MQ=255) ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaa > 1:914495‑M2/1‑49 (MQ=255) gactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAatt > 1:680902‑M2/46‑150 (MQ=255) ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattc > 2:812220‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAattatt > 2:502512‑M2/44‑151 (MQ=255) gagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAAttatta < 1:943983‑M2/109‑1 (MQ=255) gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagc > 1:755650‑M2/1‑44 (MQ=255) aTTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagc < 2:277831‑M2/149‑108 (MQ=255) cagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATc < 1:56895‑M2/113‑1 (MQ=255) tAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcg < 2:241106‑M2/151‑116 (MQ=255) gagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAat < 1:889144‑M2/119‑1 (MQ=255) aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgc < 2:418961‑M2/151‑117 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGc < 2:205679‑M2/123‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtc < 2:355094‑M2/151‑121 (MQ=255) gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtc < 1:388941‑M2/150‑121 (MQ=255) cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcag > 1:371460‑M2/1‑29 (MQ=255) aaaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcaga > 1:881963‑M2/1‑28 (MQ=255) aaaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcaga > 2:250188‑M2/1‑28 (MQ=255) aaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagac > 1:750788‑M2/1‑27 (MQ=255) ccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGagtg > 1:592805‑M2/20‑150 (MQ=255) ccgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgc > 1:1027184‑M2/20‑151 (MQ=255) cAATAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagac < 2:488582‑M2/147‑125 (MQ=255) cgcttattcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgct > 1:169793‑M2/19‑151 (MQ=255) aTAAATCTATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaa < 1:273589‑M2/150‑130 (MQ=255) attcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTgcttgctt > 2:95387‑M2/14‑151 (MQ=255) attcgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTgcttgctt > 1:744919‑M2/14‑151 (MQ=255) tATGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatt < 1:487923‑M2/151‑138 (MQ=255) cgcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCg > 1:897373‑M2/11‑151 (MQ=255) gcaccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGt > 1:888350‑M2/10‑151 (MQ=255) aTGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacaggattcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagat > 2:1330‑M2/1‑13 (MQ=255) tGCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatttt < 1:240069‑M2/151‑140 (MQ=255) gCTTTTGCTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatttt > 2:297821‑M2/1‑11 (MQ=255) accttccCTATTTTTGTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAAACTGTAATATGCGTTGTGTGCTTGCGCGCGTc < 2:120261‑M2/143‑1 (MQ=255) ccttccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCa < 2:239206‑M2/144‑1 (MQ=255) tccCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAata < 1:28419‑M2/147‑1 (MQ=255) cTATggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtccc < 2:439490‑M2/151‑148 (MQ=255) tATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGc > 2:142064/1‑151 (MQ=255) | CATTCTTTATTTTAGCTTTTCTTATGTGTTCTTCATCAACACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGC > NC_000913/2469504‑2469798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |