| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,469,647 | IS5 (+) +4 bp | coding (517‑520/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2102943 | NA (NA) | 67 (1.060) | 58/298 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2469650 | 0 (0.000) | coding (520/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 54 (0.850) | 48/298 | 0.6 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2469647 = | 0 (0.000) | coding (517/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |