New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 925901 = | 63 (0.840) | 10 (0.130) +C |
8/296 | 10.9 | 16.1% | noncoding (71/88 nt) | serW | tRNA‑Ser |
? | NC_000913 | = 1097399 | 42 (0.560) | intergenic (+570/+166) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAATT > NC_000913/925753‑926051 | gTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTc < 1:400533/151‑1 (MQ=255) tCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGtt > 2:179223/1‑148 (MQ=255) tCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑g < 1:32106/150‑1 (MQ=255) cGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTC‑T‑GAccccc > 2:176517/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGa < 2:610092/151‑1 (MQ=255) cAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTg < 1:359674/151‑1 (MQ=255) gCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGGTTG‑G‑AAcccccccacgttgcc > 1:620586/1‑141 (MQ=37) ttAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑AGGGGGGGGTC‑G‑GACCCCCGACACGTTTcc > 2:210366/1‑149 (MQ=37) tAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AAccccccccacgtttcc > 1:116774/1‑137 (MQ=37) tAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCg < 2:745738/149‑1 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AAACCCCCCAACGTTGTCg > 1:463686/1‑148 (MQ=37) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AACCCCCCATACGtt > 1:871431/1‑144 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGta < 1:220766/150‑1 (MQ=255) gAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGtata < 1:996817/151‑1 (MQ=255) ttCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCCAGACGTTGcc > 2:642130/1‑142 (MQ=255) acaGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACtt < 1:627533/151‑1 (MQ=255) aCTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTg < 1:172832/150‑1 (MQ=255) cACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCt < 2:570795/151‑1 (MQ=255) cccGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCGATACGTTGGCGTATACAA‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCtt > 2:364103/1‑150 (MQ=255) ccGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AAACCCCCCTACGTTTCCGTATACAC‑ACCTTTCCGGC‑GGGCTCCtt > 2:199162/1‑149 (MQ=18) cGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAg < 2:490858/151‑1 (MQ=255) cccACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGG‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCCATACGTTGCCGTATACAC‑ACCTTTCCGGC‑GTGCTCCTTCAGcc > 2:238735/1‑151 (MQ=255) ccaccaTGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑GAAACCCCCCAACCGTT‑CCGTATATAC‑ACTTTCCATGC‑GTGCGcccttcgcc > 1:997869/1‑143 (MQ=18) accaTGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑Ct < 2:796188/151‑1 (MQ=255) tGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑C‑GACCCCCCCCACGTTGCCGGTTACAC‑ACCTTTCCGGC‑GTGCTCCTTctacccctc > 1:503509/1‑140 (MQ=18) ttCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGCGA‑GGGGGGGGTTCTT‑AACCCCCG‑TACGTCGCCGCATAAAC‑ACATTCCCGGC‑GGGCTCCTTCAGc > 2:233662/1‑141 (MQ=18) aCTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AACCCCCCATACGTTGCCGTTTACAC‑ACTTTTCAGGC‑GTGGTCCCTCCGcccccccggcaccc > 1:810164/1‑139 (MQ=17) tACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGAGA‑GGGGGGGGTTC‑G‑GAACCCCGGTACGTTTCCGTATACAC‑ACTTTCCAAGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CC‑CCGGCACCTCAcc > 1:796699/1‑148 (MQ=17) agaTAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGtttt < 1:455094/151‑1 (MQ=255) gaTAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTg < 2:483857/151‑1 (MQ=255) aaaaTGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AAACCCCCATACGTTTCCGTTTAAAA‑ACCTTCCCGGC‑GGGGTCCTTCCGCCA‑CC‑CCGGCACCCCCCCCAAAtttttt > 1:275432/1‑147 (MQ=9) aaaTGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTC‑G‑GAACCCCCATACGTTTGCGCATACAC‑ACTTTTCAGGC‑GGGCCCCCTTAGCCC‑CC‑CCGGCACCCCACCCAAATGtttt > 2:390130/1‑146 (MQ=9) tGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCCATACGTTGGCGTATACAC‑ACTTTTCAGGC‑GGGCTCCCTTAGCCC‑CC‑CGGACACCCCACCAAAATGTTTTTCTAcc > 2:627435/1‑149 (MQ=14) tGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTT‑G‑AACCCCCGCTACGTTTCCGTATATAC‑ACTTTTCAAGC‑GTGCTCCTTCAGCCC‑CC‑CCGGCACCTCACCAAAATGTTTTTCTTcc > 1:1174376/1‑149 (MQ=11) aaaaGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATg < 2:713891/151‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTT‑G‑GACCCCCCCTACGGTGCCGGATAAAA‑ACCTTCCCGGCGGGGCTCCTTC‑GCCACCC‑CGGCCCCCCCCCAAAATTTTTTTTTTACCAAcccccttg > 1:942683/1‑146 (MQ=2) aaGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTC‑G‑AACCCCCCCTACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCCGGC‑GGGCTCCTTCCGCCC‑CC‑CGGACACCCCACCAAAATTTTTTTTTACCCAACCCCCTggg > 2:1088390/1‑151 (MQ=11) aGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AACCCCCGGAACGGTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GGGGTCCCTCAGCCA‑AC‑CGGGCAACCCAACAAAATGTTTTTGTTCCAAAcaccctggg > 1:362542/1‑142 (MQ=2) aGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGt < 2:997128/151‑1 (MQ=255) gCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGGGGG‑GGGGGGGATTG‑T‑AACCCCC‑ATACGTTTGCGTATTCAC‑ACCTTTCTGGG‑GTGGTCCTTCCGCCA‑CC‑CGGACACCCCCCCCAAATGTTTTTCTTCCCAAcaccacagggggga > 1:570686/1‑137 (MQ=2) gCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AACCCCCCATACGTTGCCCGATACAC‑ACTTTTCAGGC‑GTGCTCCTTCCGCCA‑CT‑CGGGCACCCCCCCCAAATGTTTTTTTACCAAACCTCATtggtgg > 2:867953/1‑148 (MQ=14) tCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑GAACCCCCCCACGTTTCCGTATACAA‑ACCTTTCCGGC‑GGGCTCCCTCAGCCA‑CT‑CCGGCACCCCACCCAAATTTTTTTCTACCAAAACTCATGGGGGGGAACgggg > 1:111758/1‑150 (MQ=9) tCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTT‑G‑AACCCCCCCTACGTTTCCGTATAAAC‑ACTTTTCAGGC‑GTGGTCCTTCCGCCA‑CC‑CGGACACCCCCCCCAAATTTTTTTTTACCCAACCCCCTTGGTGGGAACgggg > 2:483735/1‑150 (MQ=2) tCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACgggg < 1:1038725/150‑1 (MQ=255) cGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTTA‑GGGGGGGGTTC‑G‑GACCCCCCCAACGTTTGCGTATACAC‑ACCTTCCAGGG‑GTGGTCCTTCCCCCA‑CC‑CGGACACCCCACCCAAATTTTTTTCTACCAAACACCAAGGGGGGGAACGGGgcg > 1:853010/1‑151 (MQ=9) cGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGgc < 1:1114189/150‑1 (MQ=255) gTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGG‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCCCCTCGCTTGCATCTAAACAACTTTCTA‑GC‑GCGGTCCTTCTTCCA‑CC‑CCGGCAACTCCCCAAAATGTTTTGCTTTCCAAACTCATAGGGGGGAAAggggggg > 1:1060117/1‑148 (MQ=2) cGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTTA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCCCCACCTTTCCGTATAAAC‑ACATTTCAGGC‑GGGCTCCTTCAGCCA‑CC‑CCGGCACCCCACCCAAATGTTTTTTTAACAAAACCCCTGGGTGGGAACgggg > 1:389669/1‑145 (MQ=2) cGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGctac < 1:936631/151‑1 (MQ=255) gAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGT‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCCACACCTTGCCGTATAAAC‑ACTTTCCAAGG‑GTGCTCCTTCAGCCC‑CC‑CGGGCACCCCACCAAAATTTTTTTTTACCAAAACTCATGGGGGGCAACGGGGGGccac > 1:803486/1‑150 (MQ=9) gAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTC‑G‑AACCCCCCCTACGGTGCCGTATACAC‑ACCTTCCAAGC‑GCGCCCCTTCAGCCA‑CC‑CGGGCACCCCACCAAAATGTTTTTCTTCCAAACCTCATTGGGGGCAACGGGgggc > 2:587330/1‑147 (MQ=14) aGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑CAACCCCCATACGTTTGCGTATAAAC‑ACCTTCCAGGC‑GTGGTCCTTTCTCCA‑CTCCGGCAACCCCCCCAAATT‑TTTTTTTACCCAAACTCATGGGGGGGGACgggggg > 1:780851/1‑143 (MQ=2) cttTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AACCCCCCCTACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CC‑CCGACACCTCACCAAATTGTTTTTCTACCAAACCTCCTGGGTGGCAAAGGGGCGCTACTATAggg > 2:749816/1‑149 (MQ=18) tttAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGGTC‑G‑AAACCCCCATACGTTTTCGTATAAAC‑ACTTTTCAGGC‑GGGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CCGACACCCCCCCAAATTGTTTTTCTACCAAACCTCCTGGGGGGCGACGGGGCGCTACTATAggggg > 1:193778/1‑148 (MQ=17) ttAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGGTTT‑G‑AACCCCCCCTACGCTGCCGTCTACAC‑ACTTTTCAGGC‑GGGGTCCCTCCGCCC‑CA‑CGGCGACCCCACCCAAATGTTTTTCTACCCAACCCCCTGGGTGGCCACGGGGCGCCACTATAgggggg > 1:942595/1‑147 (MQ=12) ttAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAg < 2:589515/149‑1 (MQ=255) ttAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGt < 1:303960/150‑1 (MQ=255) aaTATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGa < 1:38072/151‑1 (MQ=255) gC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTaaaa < 2:1019612/151‑1 (MQ=255) ggTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg > 2:861536/1‑151 (MQ=255) ggTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg > 2:41304/1‑151 (MQ=255) gA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGt < 1:269696/150‑1 (MQ=255) gggggggATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaa < 2:707099/151‑1 (MQ=255) gggggggATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCa < 2:605069/150‑1 (MQ=255) ttC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAAtt > 1:986576/1‑151 (MQ=255) | GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTC‑G‑AACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑ACTTTCCAGGC‑GTGCTCCTTCAGCCA‑CT‑CGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAATT > NC_000913/925753‑926051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |