| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 944,912 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+16/+14) | dmsC → / ← ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 68 (0.910) | 55/292 | 0.6 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 944917 | 0 (0.000) | intergenic (+21/+14) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 90 (1.210) | 73/292 | 0.1 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 944912 = | 0 (0.000) | intergenic (+16/+19) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACC > NC_000913/944770‑945064 | tggagcttacagggcgccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttcagttcgcgcttatgggTTTCGGccc > 1:337095‑M2/143‑151 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCgg < 2:652444‑M2/6‑1 (MQ=255) gagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCg > 2:26491‑M2/141‑151 (MQ=255) aaGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcc < 1:653811‑M2/148‑3 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg < 1:884216‑M2/12‑1 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg > 1:197173‑M2/140‑151 (MQ=255) aGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccata > 2:102264‑M2/1‑145 (MQ=255) gTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataag > 2:446201‑M2/1‑143 (MQ=255) 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cGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgt < 1:919551‑M2/151‑27 (MQ=255) gggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTc < 1:1098455‑M2/32‑1 (MQ=255) gggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTc < 2:211350‑M2/32‑1 (MQ=255) gggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTc < 1:585726‑M2/32‑1 (MQ=255) gCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtg > 2:11742‑M2/1‑124 (MQ=255) 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gtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattattcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGACCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACg > 1:1025452‑M2/113‑151 (MQ=255) tCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:707739‑M2/151‑35 (MQ=255) tccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACgtgt > 1:1097383‑M2/110‑151 (MQ=255) tGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttg < 2:514238‑M2/140‑26 (MQ=255) tATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtat < 2:968644‑M2/144‑32 (MQ=255) 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gCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcc < 2:869275‑M2/151‑97 (MQ=255) gCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc > 1:420140‑M2/1‑55 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTc < 1:78105‑M2/102‑1 (MQ=255) atatGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggccc < 1:523802‑M2/150‑98 (MQ=255) gACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:44284‑M2/1‑49 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCa > 2:899089‑M2/44‑150 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAat < 2:849417‑M2/109‑1 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAatat < 2:144877‑M2/111‑1 (MQ=255) ggggATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaa > 1:691617‑M2/1‑43 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCAtt > 2:639450‑M2/37‑151 (MQ=255) ggATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcc > 2:972132‑M2/1‑41 (MQ=255) gATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagccc > 1:1027478‑M2/1‑40 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTa < 2:32963‑M2/116‑1 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACg > 2:35878‑M2/34‑151 (MQ=255) ggCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccga > 2:341195‑M2/1‑37 (MQ=255) 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cGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAAcc > 2:72430/1‑150 (MQ=255) | AAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACC > NC_000913/944770‑945064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |