| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 944,912 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+16/+14) | dmsC → / ← ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 68 (0.910) | 55/292 | 0.6 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 944917 | 0 (0.000) | intergenic (+21/+14) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 90 (1.210) | 73/292 | 0.1 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 944912 = | 0 (0.000) | intergenic (+16/+19) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCC > NC_000913/944762‑945059 | ccacAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGt < 1:170110/151‑1 (MQ=255) gtcatctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggttt < 2:814545‑M2/3‑1 (MQ=255) tcatctggagcttacaggtggccattcatgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTc > 1:386363‑M2/148‑151 (MQ=255) caGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTc < 1:1091204/151‑1 (MQ=255) catctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTc < 2:575415‑M2/4‑1 (MQ=255) aGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCg > 2:847829/1‑151 (MQ=255) tggagcttacagggcgccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaatggaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttcagttcgcgcttatgggTTTCGGccc > 1:337095‑M2/143‑151 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCgg < 2:652444‑M2/6‑1 (MQ=255) gagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCg > 2:527746‑M2/141‑151 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg > 1:197173‑M2/140‑151 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg < 1:884216‑M2/12‑1 (MQ=255) gTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataag > 2:446201‑M2/1‑143 (MQ=255) gTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataag > 2:10752‑M2/1‑143 (MQ=255) acaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTtctc < 2:861576‑M2/17‑1 (MQ=255) aggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCtt > 2:265401‑M2/133‑151 (MQ=255) aGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaa > 2:117651‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaactt < 2:1173985‑M2/151‑18 (MQ=255) gccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTAtt > 2:585732‑M2/128‑151 (MQ=255) 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cGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgt < 2:1041224‑M2/151‑27 (MQ=255) cGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgt < 1:919551‑M2/151‑27 (MQ=255) gggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTc < 1:585726‑M2/32‑1 (MQ=255) cTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGCATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttacgggttgtgg < 2:418509‑M2/151‑29 (MQ=255) acagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTa < 1:720608‑M2/36‑1 (MQ=255) agtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAAc > 1:456621‑M2/114‑151 (MQ=255) gtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACg < 2:81187‑M2/39‑1 (MQ=255) gtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattattcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGACCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACg > 1:1025452‑M2/113‑151 (MQ=255) tccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACgtgt > 1:1097383‑M2/110‑151 (MQ=255) tATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtat < 2:968644‑M2/144‑32 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCa < 2:871585‑M2/44‑1 (MQ=255) cattcattCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGc > 1:486930‑M2/1‑110 (MQ=255) cattcattCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGc < 2:486933‑M2/111‑2 (MQ=255) attcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 2:712399‑M2/1‑109 (MQ=255) cagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACt > 1:1195264‑M2/103‑151 (MQ=255) cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGt > 2:661643‑M2/100‑151 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gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATc > 2:715249‑M2/81‑150 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATc > 1:19782‑M2/81‑150 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATc > 1:428933‑M2/81‑150 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCa < 2:904280‑M2/71‑1 (MQ=255) aaTTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt < 1:630459‑M2/150‑65 (MQ=255) 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atGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccata > 2:749912‑M2/1‑51 (MQ=255) cattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAat > 2:1037740‑M2/42‑150 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAatat < 2:144877‑M2/111‑1 (MQ=255) ggggATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaa > 1:691617‑M2/1‑43 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCAtt > 2:639450‑M2/37‑151 (MQ=255) ggATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcc > 2:972132‑M2/1‑41 (MQ=255) gATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagccc > 1:1027478‑M2/1‑40 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTa < 2:32963‑M2/116‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTAc < 2:306160‑M2/117‑1 (MQ=255) ggCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccga > 2:341195‑M2/1‑37 (MQ=255) ggCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccga < 1:321444‑M2/150‑114 (MQ=255) ggCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccga < 2:858626‑M2/150‑114 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGcc > 2:112785‑M2/30‑149 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGcc > 1:567203‑M2/30‑149 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCa < 2:857038‑M2/121‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |