| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 308,054 | (C)7→10 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 308047 | 1 (0.020) | 60 (1.420) +CCC |
52/278 | 0.0 | 98.4% | coding (1286/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| ? | NC_000913 | 308048 = | 1 (0.020) | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein | |||||
GCTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTT > NC_000913/307902‑308191 | gCTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccc < 1:292735‑M1/151‑6 (MQ=255) gTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccca < 2:188942‑M1/151‑11 (MQ=255) tCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccca > 1:76461‑M1/1‑140 (MQ=255) cGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaag < 2:368480‑M1/151‑13 (MQ=255) cAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcg < 2:376872‑M1/151‑15 (MQ=255) tgattgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggc > 1:607671‑M1/1‑133 (MQ=255) tgattgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggc > 2:304299‑M1/1‑133 (MQ=255) gattgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagc > 1:29412‑M1/1‑132 (MQ=255) gCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtca < 1:677571‑M1/151‑24 (MQ=255) ccAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAGAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtc > 2:401320‑M1/1‑127 (MQ=255) cAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccccaagcggcagcgtc > 1:565557‑M1/1‑126 (MQ=255) aTGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacg > 1:610917‑M1/1‑124 (MQ=255) ttCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcaccc < 1:650415‑M1/150‑38 (MQ=255) ccTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccacc > 1:279769‑M1/1‑111 (MQ=255) tGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgc > 1:226097‑M1/1‑109 (MQ=255) gATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcc < 1:625421‑M1/151‑44 (MQ=255) gATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccg < 2:520841‑M1/149‑42 (MQ=255) aTTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcc > 2:613350‑M1/1‑107 (MQ=255) ttAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctg > 2:47322‑M1/1‑106 (MQ=255) tAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctg < 1:190074‑M1/150‑46 (MQ=255) aaCCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgat < 2:523497‑M1/151‑48 (MQ=255) acaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcg > 2:566429‑M1/1‑99 (MQ=255) caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgt > 2:221642‑M1/1‑98 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatcc > 1:148491‑M1/1‑93 (MQ=255) aCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccat > 1:68676‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatat < 2:265922‑M1/150‑62 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcc < 2:545140‑M1/151‑64 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgt > 2:265136‑M1/1‑85 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgc > 1:212034‑M1/1‑82 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgc < 1:304306‑M1/151‑70 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgtt < 1:456764‑M1/149‑68 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCCCTGATGCTGCCCATGCTGCTCCATGCGCTGTCACTGGCCAGCATGTTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcggcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttg < 2:45026‑M1/150‑69 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgcc < 2:34738‑M1/151‑71 (MQ=255) cGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccg < 2:408930‑M1/151‑72 (MQ=255) ggcagagtggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccg > 1:78894‑M1/4‑79 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccccagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgccc > 2:3214‑M1/1‑76 (MQ=255) gagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccag < 1:580974‑M1/151‑77 (MQ=255) gcgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaag < 1:527088‑M1/151‑82 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagcta > 1:145911‑M1/1‑69 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactca > 2:581877‑M1/1‑61 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagcc > 1:413483‑M1/1‑54 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccgg > 2:48742‑M1/1‑52 (MQ=255) gctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggag < 1:460102‑M1/150‑101 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgag < 1:646478‑M1/151‑107 (MQ=255) tGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacct > 1:441832‑M1/1‑39 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacct < 1:204677‑M1/150‑113 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacct < 2:539340‑M1/150‑113 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgct > 1:27258‑M1/1‑36 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgct > 1:211153‑M1/1‑36 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgc > 2:483984‑M1/1‑36 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgct > 2:539721‑M1/1‑35 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgct > 2:631818‑M1/1‑35 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagcc > 2:429966‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagcca > 1:426757‑M1/1‑30 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactct > 2:203665‑M1/1‑26 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctcttt < 1:491021‑M1/150‑130 (MQ=255) gCAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctctttagct > 1:19211‑M1/1‑18 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctctttagctg < 2:81709‑M1/151‑135 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTc < 1:366377/151‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctctttagctggtcg > 1:362954‑M1/1‑13 (MQ=255) cGTTGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctctttagctggtcgcgtc < 1:566053‑M1/151‑143 (MQ=255) ttGATCGcccccccccaagcggcagcgtcagacgggtttcacccaccgcctgattatcgtatccatatcccgttgccgcccagctaagcgtactcaatgagccggaggtcgaggcacctgctagccaactctctttagctggtcgcgtctt > 1:76005‑M1/1‑7 (MQ=255) | GCTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTT > NC_000913/307902‑308191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |