| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 308,054 | (C)7→10 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 308047 | 1 (0.020) | 60 (1.420) +CCC |
52/278 | 0.0 | 98.4% | coding (1286/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| ? | NC_000913 | 308048 = | 1 (0.020) | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein | |||||
ATCGCTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTCCCGTT > NC_000913/307899‑308198 | gctacgtcgcaattgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccccc < 1:292735‑M2/2‑1 (MQ=255) gtcgcaattgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccccccccca < 2:188942‑M2/7‑2 (MQ=255) tcgcaattgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccccccccca > 1:76461‑M2/144‑149 (MQ=255) cgcaattgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgcccccccccaag < 2:368480‑M2/9‑4 (MQ=255) caattgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCg < 2:376872‑M2/12‑1 (MQ=255) tgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGc > 1:607671‑M2/136‑149 (MQ=255) tgattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGc > 2:304299‑M2/136‑149 (MQ=255) gattgccaatgcgggttttttcctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGc > 1:29412‑M2/135‑151 (MQ=255) 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cctgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc > 1:279769‑M2/114‑151 (MQ=255) tgattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 1:226097‑M2/112‑151 (MQ=255) gattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg < 2:520841‑M2/39‑1 (MQ=255) gattaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc < 1:625421‑M2/41‑1 (MQ=255) attaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 2:613350‑M2/110‑150 (MQ=255) ttaacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg > 2:47322‑M2/109‑151 (MQ=255) taacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg < 1:190074‑M2/43‑1 (MQ=255) aacccacagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt < 2:523497‑M2/45‑1 (MQ=255) acagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg > 2:566429‑M2/102‑151 (MQ=255) cagcgaactaaagcctcccggtagagtggcgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGt > 2:221642‑M2/101‑151 (MQ=255) 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cgctgatgctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgcccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 1:145911‑M2/73‑149 (MQ=255) ctgccgatgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa > 2:581877‑M2/64‑150 (MQ=255) tgctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgcccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc > 1:413483‑M2/58‑151 (MQ=255) ctgctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 2:48742‑M2/55‑150 (MQ=255) gctccatgagctgtcactggccagcatattttgcaggttaacgttgatcgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAg < 1:460102‑M2/98‑1 (MQ=255) 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cgccCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTcc > 2:426839‑M2/5‑151 (MQ=255) cCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTCCCGt < 1:366722‑M2/150‑1 (MQ=255) cccccccAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTCCCGtt < 2:159476/151‑1 (MQ=255) cccccccAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTCCCGtt > 2:291119/1‑151 (MQ=255) | ATCGCTACGTCGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGTCGCGTCTTTTTCCCGTT > NC_000913/307899‑308198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |