| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 1 (0.010) | 124 (1.160) | 104/298 | 0.0 | 98.0% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673713 = | 4 (0.040) | intergenic (‑212/‑200) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATCACCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAG > NC_000913/1673383‑1673681 | atcaCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAat > 1:643474‑M1/1‑149 (MQ=255) tcaCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAatt > 4:416593‑M1/1‑148 (MQ=255) caCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAatta < 4:814956‑M1/151‑5 (MQ=255) caCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAatt > 4:543359‑M1/1‑147 (MQ=255) ccAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattaca < 1:1452636‑M1/151‑7 (MQ=255) cAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaa < 1:862571‑M1/151‑8 (MQ=255) gCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaatt < 4:1140483‑M1/151‑10 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattat < 1:486013‑M1/151‑12 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattat > 4:549051‑M1/1‑140 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccg > 1:1222369‑M1/1‑137 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccg > 4:242051‑M1/1‑137 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatcc < 4:1197039‑M1/150‑14 (MQ=255) aaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgc < 4:573446‑M1/151‑16 (MQ=255) aaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgc > 4:698382‑M1/1‑135 (MQ=255) aaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgc > 1:1141811‑M1/1‑135 (MQ=255) aaaGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtg < 1:498523‑M1/151‑20 (MQ=255) aaaGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtg < 1:330460‑M1/151‑20 (MQ=255) aGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAATAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagt < 3:31343‑M1/148‑19 (MQ=255) cgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgct > 1:1395303‑M1/1‑127 (MQ=255) cgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgct < 1:254983‑M1/151‑25 (MQ=255) gccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgctt < 4:1379176‑M1/151‑26 (MQ=255) gccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgctt < 4:501792‑M1/151‑26 (MQ=255) ccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttc < 4:903476‑M1/151‑27 (MQ=255) tttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcg > 1:1148417‑M1/1‑122 (MQ=255) tCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 3:107430‑M1/1‑120 (MQ=255) ccTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcat > 2:133678‑M1/1‑118 (MQ=255) aCTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcg < 4:730598‑M1/151‑38 (MQ=255) aCTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcg > 4:863282‑M1/1‑114 (MQ=255) cTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 2:113106‑M1/1‑113 (MQ=255) cGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatg > 2:59111‑M1/1‑109 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat < 1:1249124‑M1/151‑44 (MQ=255) cGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataa < 4:1470005‑M1/150‑46 (MQ=255) ccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgt < 4:186524‑M1/151‑50 (MQ=255) tttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcct > 1:339864‑M1/1‑99 (MQ=255) tttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcc < 4:1433970‑M1/150‑52 (MQ=255) ttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctc > 4:1108654‑M1/1‑98 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtag < 4:373360‑M1/150‑59 (MQ=255) cAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttg > 1:1108578‑M1/1‑90 (MQ=255) gTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaaca < 4:196875‑M1/151‑66 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacg > 4:835188‑M1/1‑84 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacac < 2:3115‑M1/150‑67 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcc < 2:19825‑M1/151‑70 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcc > 1:935025‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgat < 1:603277‑M1/151‑74 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatt < 4:767225‑M1/151‑75 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatt < 1:1067387‑M1/151‑75 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatt < 1:1061085‑M1/151‑75 (MQ=255) tCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt > 4:1354635‑M1/1‑74 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatc > 1:1417366‑M1/1‑71 (MQ=255) gCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatca < 4:1348236‑M1/149‑82 (MQ=255) cAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatag < 1:441159‑M1/151‑85 (MQ=255) cAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat > 1:983405‑M1/1‑67 (MQ=255) aaTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagc > 3:81695‑M1/1‑66 (MQ=255) aTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagct < 4:910669‑M1/151‑87 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctt < 3:114868‑M1/150‑88 (MQ=255) gCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctta > 1:887778‑M1/1‑62 (MQ=255) gACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaat < 4:544591‑M1/151‑94 (MQ=255) aCCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt < 1:1319404‑M1/151‑95 (MQ=255) aCCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 1:485884‑M1/1‑57 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta < 1:1140716‑M1/151‑96 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 4:632106‑M1/1‑56 (MQ=255) cTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta > 4:689115‑M1/1‑55 (MQ=255) cTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta > 1:877452‑M1/1‑55 (MQ=255) aataaAATCCAATAAAGATAGATAGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaact < 4:884779‑M1/151‑99 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactc < 4:1252768‑M1/151‑100 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactc < 1:397426‑M1/151‑100 (MQ=255) aaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaa < 1:703522‑M1/151‑104 (MQ=255) aaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaa > 3:120761‑M1/1‑48 (MQ=255) aaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTc < 1:304413/151‑1 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 2:28051‑M1/151‑107 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat > 4:102170‑M1/1‑45 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 4:626972‑M1/151‑107 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat > 4:407524‑M1/1‑45 (MQ=255) cAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatt < 1:509453‑M1/151‑108 (MQ=255) aataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattt > 4:1348120‑M1/1‑43 (MQ=255) aataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattt > 4:1428911‑M1/1‑43 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattttcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt < 4:113048‑M1/151‑110 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt < 4:154222‑M1/151‑110 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt > 4:209028‑M1/1‑42 (MQ=255) aataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcac > 4:401595‑M1/1‑39 (MQ=255) aCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctt < 1:1348239‑M1/151‑118 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttt > 4:493889‑M1/1‑33 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttt > 4:799054‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttcttta < 1:627273‑M1/151‑120 (MQ=255) ttGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttac > 1:467482‑M1/1‑31 (MQ=255) ccTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctga < 1:1387568‑M1/151‑125 (MQ=255) ccTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctg > 1:1117050‑M1/1‑27 (MQ=255) cTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctg > 4:1004853‑M1/1‑26 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtt > 4:677245‑M1/1‑21 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctctacctgagcggtt > 1:415285‑M1/1‑21 (MQ=255) cTGCAAGAGAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggttt > 1:1129377‑M1/1‑20 (MQ=255) agagAATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattt > 4:623362‑M1/1‑15 (MQ=255) gaATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcg < 4:1141721‑M1/151‑140 (MQ=255) gaATTATTTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcg < 4:49070‑M1/151‑140 (MQ=255) attTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttgcctgagcggtttgattttcgttat < 3:178965‑M1/150‑144 (MQ=255) attTTAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatg > 3:179650‑M1/1‑7 (MQ=255) ttttAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatg > 2:109228‑M1/1‑6 (MQ=255) tAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgatg > 4:647341‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgatg > 4:366052‑M1/1‑3 (MQ=255) aattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcacttctttacctgagcggtttgattttcgttatgatgacg < 3:117134‑M1/151‑151 (MQ=255) | ATCACCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAG > NC_000913/1673383‑1673681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |