| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 1 (0.010) | 124 (1.160) | 104/298 | 0.0 | 98.0% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673713 = | 4 (0.040) | intergenic (‑212/‑200) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACG > NC_000913/1673564‑1673862 | atcaccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaAt > 1:643474‑M2/150‑151 (MQ=255) tcaccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaAtt > 4:416593‑M2/149‑151 (MQ=255) caccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaAtt > 4:543359‑M2/148‑150 (MQ=255) caccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTa < 4:814956‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACa < 1:1452636‑M2/6‑1 (MQ=255) aaGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACa > 1:817799/1‑150 (MQ=255) gcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAAtt < 4:1140483‑M2/9‑1 (MQ=255) gcattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAAtt > 1:1366169‑M2/143‑151 (MQ=255) cattaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTa < 4:1137283‑M2/10‑1 (MQ=255) attaaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTAt > 4:549051‑M2/141‑151 (MQ=255) aaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATcc < 4:1197039‑M2/13‑1 (MQ=255) aaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCg > 1:1222369‑M2/138‑151 (MQ=255) aaaataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCg > 4:242051‑M2/138‑151 (MQ=255) aataaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGc > 1:1141811‑M2/136‑150 (MQ=255) aaagccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAgtg < 1:498523‑M2/19‑1 (MQ=255) agccgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGtt > 4:739556‑M2/131‑151 (MQ=255) cgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCt > 1:1395303‑M2/128‑151 (MQ=255) cgccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCt < 1:254983‑M2/24‑1 (MQ=255) gccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCtt < 4:1379176‑M2/25‑1 (MQ=255) ccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtc < 4:903476‑M2/26‑1 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGt < 1:1164968‑M2/30‑1 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTc > 3:107430‑M2/121‑151 (MQ=255) cctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAt > 2:133678‑M2/119‑151 (MQ=255) actgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgcg < 4:730598‑M2/37‑1 (MQ=255) actgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgcg > 4:1001467‑M2/115‑151 (MQ=255) ctgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCgg > 2:113106‑M2/114‑151 (MQ=255) gctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatgat > 4:1267739‑M2/109‑151 (MQ=255) gctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatgat < 1:1249124‑M2/43‑1 (MQ=255) cgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATaa < 4:1470005‑M2/45‑1 (MQ=255) ccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGt < 4:186524‑M2/49‑1 (MQ=255) tttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTcc < 4:1433970‑M2/51‑1 (MQ=255) tttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCt > 1:339864‑M2/100‑151 (MQ=255) ttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc > 4:1108654‑M2/99‑151 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAg < 4:373360‑M2/58‑1 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGt < 3:102913‑M2/59‑1 (MQ=255) cagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTg > 1:1108578‑M2/91‑151 (MQ=255) cgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac > 1:480204‑M2/88‑151 (MQ=255) gtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAaca < 4:196875‑M2/65‑1 (MQ=255) accggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAacac < 2:3115‑M2/66‑1 (MQ=255) accggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACg > 4:835188‑M2/85‑151 (MQ=255) cggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc > 1:935025‑M2/83‑151 (MQ=255) cggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc < 2:19825‑M2/69‑1 (MQ=255) taatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTg > 1:340262‑M2/80‑150 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGa < 1:1122880‑M2/72‑1 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAt < 1:603277‑M2/73‑1 (MQ=255) atttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAtt < 4:767225‑M2/74‑1 (MQ=255) atttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAtt < 1:1061085‑M2/74‑1 (MQ=255) atttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAtt < 1:1067387‑M2/74‑1 (MQ=255) tctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 4:1354635‑M2/75‑151 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt < 4:1425844‑M2/79‑1 (MQ=255) tagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATc < 4:595626‑M2/80‑1 (MQ=255) gcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 4:1348236‑M2/81‑1 (MQ=255) caatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAt > 1:983405‑M2/68‑149 (MQ=255) aatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGc > 3:81695‑M2/67‑151 (MQ=255) atagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCt < 4:910669‑M2/86‑1 (MQ=255) atagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCt > 3:173675‑M2/66‑151 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCtt < 3:114868‑M2/87‑1 (MQ=255) gccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 1:887778‑M2/63‑150 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 4:668652‑M2/61‑148 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGaa < 4:522233‑M2/92‑1 (MQ=255) gacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAt < 4:544591‑M2/93‑1 (MQ=255) acctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt > 1:485884‑M2/58‑151 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTa < 1:1140716‑M2/95‑1 (MQ=255) ctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTa > 4:689115‑M2/56‑150 (MQ=255) ctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTa > 1:877452‑M2/56‑150 (MQ=255) aataaaatccaataaagatagatagtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACt < 4:884779‑M2/98‑1 (MQ=255) ataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTc < 4:1252768‑M2/99‑1 (MQ=255) ataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTc < 1:397426‑M2/99‑1 (MQ=255) aatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCaaaa < 1:703522‑M2/103‑1 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAatat > 4:102170‑M2/46‑151 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAatat < 4:626972‑M2/106‑1 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAatat < 2:28051‑M2/106‑1 (MQ=255) caataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtt < 1:509453‑M2/107‑1 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTTTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtttt < 4:113048‑M2/109‑1 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtttt > 4:209028‑M2/43‑151 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtttt < 4:154222‑M2/109‑1 (MQ=255) aatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAc > 4:401595‑M2/40‑151 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAct > 1:536596‑M2/39‑151 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAct > 4:852069‑M2/39‑151 (MQ=255) gTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtct < 1:1084065/151‑1 (MQ=255) acattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActtctt < 1:1348239‑M2/117‑1 (MQ=255) cattgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCttt > 4:493889‑M2/34‑151 (MQ=255) ttgtccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTAc > 1:467482‑M2/32‑151 (MQ=255) ccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTg > 1:81859‑M2/28‑150 (MQ=255) ccttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGa < 1:1387568‑M2/124‑1 (MQ=255) cttctcctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTg > 4:1004853‑M2/27‑149 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGtt > 4:414442‑M2/22‑151 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGtt > 4:677245‑M2/22‑151 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTCTACCTGAGCGGtt > 1:415285‑M2/22‑151 (MQ=255) ctgcaagagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGttt > 1:1129377‑M2/21‑151 (MQ=255) agagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGAttt > 4:623362‑M2/16‑151 (MQ=255) gagaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGAtttt > 1:188922‑M2/15‑151 (MQ=255) aaaTTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGAtttt < 4:817748/151‑1 (MQ=255) gaattattttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCg < 4:49070‑M2/139‑1 (MQ=255) attttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTGCCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTat < 3:178965‑M2/143‑1 (MQ=255) attttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTatg > 3:179650‑M2/8‑151 (MQ=255) ttttaaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTatg > 2:109228‑M2/7‑150 (MQ=255) taaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTatgatg > 4:647341‑M2/4‑150 (MQ=255) taaATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTatgatg > 4:366052‑M2/4‑150 (MQ=255) aATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACg < 3:117134‑M2/150‑1 (MQ=255) | TGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTCTTTACCTGAGCGGTTTGATTTTCGTTATGATGACG > NC_000913/1673564‑1673862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |