| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 346068 = | NA (NA) | 105 (1.210) | 90/586 | 0.0 | 99.1% | intergenic (‑51/‑107) | LY180_01675/LY180_01680 | CadC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | = 363812 | 1 (0.010) | intergenic (‑39/‑249) | LY180_01770/LY180_01775 | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamyl kinase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346363‑346068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAGC < CP006584/363812‑363517 TCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCG > 1:275226/1‑298 agttgGATTTGTTTGATGTTAGGTTTGGTTCTGGCGTTGGTTCGTAGGTTACGGCCAAGGTTGGTAAGAGTGATAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGGCAACGGTAAGCTGTTGAGTCGTTTTCAGTGTAAATCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAGATAACGAGTTCGCAGATCGTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAATCCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCGCCTTAACTTAATGAGCTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGC < 2:467454/293‑1 CGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGC < 1:25244/298‑1 GGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCc > 1:570131/1‑297 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GTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTtggcgtcag < 1:534049/298‑10 GTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCG > 2:715046/1‑298 ATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcct > 2:333860/1‑283 ATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcct < 1:333860/292‑10 GTTATTTTTTTTTCTCGCTTTGGGTGGCAGGGTATGGCCAAGGTAGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTA < 2:617177/298‑1 GTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTA > 1:664388/1‑298 ttggTTTGTTGTCGGTTGGTTTGGCAGGGTACGGCCAAGTTCGGTAAAAGTTGGGGTTTTACAGTCAAGTAATGCTTGGCAAGCCAACGTTAATCGTTGGGGTCGGTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTGGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATT < 2:314413/294‑1 tgctgTTGGTTGGGAGGGTACGGCAAAGTTGGGTAGTAGTTGGAGTGTTTCAGTCAATTAATGTTGGGCAAGCCAACTTTAAGCGTTTGAGTCGGGTTAAGTGTAATTCGGGGAAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGAACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCCTGTTATCATATGACAAGATGTGTAGCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAA < 2:636736/293‑1 CGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAAT < 1:39634/298‑1 TTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAA > 1:351467/1‑298 TTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTGCGGTAAGAGTTGGAGTTTTACAGTCAAGGAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGATTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCAACTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTCATTAAAATCAGGAATGAA < 2:458609/298‑1 GGTGGGGAGGTTAAGGCAAAGTTCGGGAAGGGTGAGAGTTTTAAAGTTAAGTAAGACGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTGGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAAT < 2:264872/298‑1 AGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAG > 1:183181/1‑298 GGTTACGGCCAAGATCGGTAAGAGGGAGGGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGA < 2:234432/298‑1 TTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAACATGAAAAAGAGC > 1:172751/1‑298 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GGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCCTTAGGGGATTCATAAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAAACAGGAATGAAAATGAAAAAAAGCACTCTGGCAATAGT > 2:347304/1‑298 AGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTG > 1:50032/1‑298 AGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGac > 1:301523/1‑296 AGTAATGCGTGGCAAGACAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTTTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGAAAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCA < 1:743549/298‑1 TAATGGGGGGGAAGCAAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATC < 2:535934/298‑1 TGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGT < 1:774809/298‑1 ggggtGCAAGACAATGTGAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTTATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGGCGTGTAAAATATCTAGTTCGTACATTGTGGTGTCTTATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCATAACTTAATGATTTTAACCAAAATCATGAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTA < 2:229103/293‑1 TGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTTATTTTTCGCGAAAGCATTTTAACATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGCATATTCGAGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGAGGGCAATTGGGTCATCTGTATCCGTACAG > 2:36991/1‑298 TGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATAAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAACTCAGTAATGAAAATGAAAAATAGCACTCTGGCATTAGTGGGGTAGGGCATTGGGGATTCGGCACCCGTACAG > 2:792151/1‑298 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CTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAAT > 2:334477/1‑216 CTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAAT < 1:334477/216‑1 TGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACA > 2:73473/1‑298 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TTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTT < 1:131108/298‑1 GGGTTTCAGCAGAGCTGAATATTCGTGCGTTAATTAAAATCAGGAAGGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCG < 2:25057/298‑1 TCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAAT < 1:792151/298‑1 TCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCACAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTT < 2:248340/218‑1 TCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCACAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTT > 1:248340/1‑218 AGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAGC < 1:411716/298‑1 TCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346363‑346068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAGC < CP006584/363812‑363517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |