| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP006584 | = 4334576 | 2 (0.020) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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ggggggATCTCTAGTTGTTGGGCACGGTCCTTTGCCCATCACAAAGTTAATGAATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGaa < 2:753457/296‑1 (MQ=255) gggggttttttcggtgtTTGGCACGGTCCGTTGCCCATAACAAGGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTAGTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCTATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAg < 2:618164/285‑1 (MQ=255) ctctcAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGt < 1:61746/298‑1 (MQ=255) | CGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCA‑GAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGT > CP006584/4187795‑4188377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |