| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
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ctaaccccttagagatcccctcataatgtccccaaaccgtaaccatggtttaataaattttgggctagtggggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttatggtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttc > 2:252500‑M2/6‑7 (MQ=255) ccctgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagacaacatgttagttgaagcagcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctagttcggcta < 1:769112‑M2/298‑297 (MQ=255) cctgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatg < 2:477942‑M2/232‑232 (MQ=255) | TCACAAACAGAACGCTCTGCGAGAACTCCTGCCCGTAGATGACGTAGTAGCATAGCGCCGCCAGAGAGGCCGCCCATAGCACCACGCCGATTACTGCGGCAATAATTTTAATCCGCTTCGGAAAGAGGAATACCGGGATCAACCACAGCGAGCTGAATAACAGCGAGTCGCGAATGCCGTTGGTGCCACTATAACCACTGATGTAAATAATGGCCTGTAGCAGAGTAGAGAAAAACCAAAAGTAGAGCAGTGCCCAACCCAGGGCTTTCCAGCTAAAAAGGGGTTTAGCCTGGACTTCTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAAATATCGCCGAATGTAACGACAATTCCTTAAGGATATCTGAAGGTATATTCAGAATTTGAATAAAATGCAGACAGAAATATATTGAAAACGAGGGTGTTAGAACAGAAGTATTTCAGAAAACCCTCGCGCAAAAGCACGAGGGTTTGCAGAAGAGGAAGATTAGCCGGTATTACGCATACCTGCCGCAATCCCGGCAATAGTGACCATTAACGCTTGTTCGACGCGAGGATCCGGTTCCTGGCCTTCTTTTTCTG > CP006584/4334287‑4334873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |