New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP006584 | 3513901 = | 43 (0.500) | 44 (0.540) +TCGGATAAGGCGTTT |
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? | CP006584 | = 3514068 | 41 (0.470) | intergenic (‑244/+95) | tldD/LY180_16725 | protease TldD/membrane protein |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TCAGGCCGTTCGCCGCTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGACTTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCACTTTACTGGCGGCAAACACTG‑CCGCGCCAACAATGGGGTTAACCGCAAAAGCCGCAGCCACGCCCACCGTCGCAGAAATCTCTG > CP006584/3513776‑3514362 | tCAGGCCGTTCGCCGCTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacg > 1:16643‑M2/1‑293 (MQ=255) aGGCCGTTCGCCGCTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCCCAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgcc < 1:145819‑M2/298‑8 (MQ=255) ttCGCCGCTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatcc < 1:192750‑M2/298‑14 (MQ=255) tgcggcgtgaacgccctatccagcctacggttatgttccggtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgaCCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGAc < 1:459302‑M1/183‑1 (MQ=255) ctgtcaggtattgtgcactTAGCAGGTTAGGACGCATCGTTTTGGCTACTGGGTGGGTGCGGGAGTAGAGGTGGTTTTACGGGTGCCGGAGGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTGCGGTTATGTTCCGGTGTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGGAACGGCTGTCGGAGGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacc > 2:671567‑M2/10‑281 (MQ=255) gcTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgaccta < 1:308071‑M2/298‑20 (MQ=255) gcTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgaccta < 1:641834‑M2/298‑20 (MQ=255) cTAGCAATTGTTCACTTACCCGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctac > 1:614259‑M2/1‑278 (MQ=255) gCTATTTTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCAAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggt > 1:509434‑M2/1‑275 (MQ=255) aTTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCACTATCCGACCTAACGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCAACGAGCCACCTCAGGTAACGGTCACCGGAAGCCAGCGaacgccttaccccacctacggcttg < 2:130234‑M2/298‑26 (MQ=255) aTTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGCCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttat > 1:187521‑M2/1‑272 (MQ=255) cctatccagcctacggttatgttccggtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgaCCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCCACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTc < 1:9605‑M1/197‑1 (MQ=255) ttCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttatgttc > 1:328836‑M2/1‑268 (MQ=255) ttCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGGAAACCCCTTATCCGACCTACGGTTATTTTCCG‑GTTGGAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCACCAGGCAACGCCTGCCGGAGGCG‑GCGTcaaccgcttctccgaccgactgttatgttt < 2:184697‑M2/298‑31 (MQ=255) atccagcctacggttatgttccggtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgaCCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTgg > 1:619442‑M1/99‑298 (MQ=255) aCTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttatgttccgt > 1:790229‑M2/1‑265 (MQ=255) aCTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTaaacaccttatccgacctacggttatgttccgt < 1:574915‑M2/298‑34 (MQ=255) aGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGCCCTACGGTTATGTTCCG‑TTTTTAGGCCTGTTAAGACGCACCGCGTCGCACCCGGCACCGGCTGCCGGATGCG‑CGGCgaaccccttctcccacctccggttattttcccgtcgtagg < 2:319422‑M2/298‑41 (MQ=255) aGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCCTCCGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GGGTCAACGCCCTACCCAGCCTCCCGTTATGtttcctttttcgg > 2:319414/1‑287 (MQ=37) 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aGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGGCACATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGTGTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGCCACGCAATGGGCGAGCGA‑CCATAGGCGCCTTTGCTCCACAGCGGCCCCATCCCTTTACTAGCGCACAACACTG‑CCGCCCACAAAATGGGGCTCACCgtcccaac > 2:306183/1‑291 (MQ=255) cGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGACTTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCACTTTACTGGCGGCAAACACTG‑CCGCGCCAACAATGGGGTTAACCGCAAAAGCCg < 1:304065/298‑1 (MQ=255) gTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGACTTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCACTTTACTGGCGGCAAACACTG‑CCGCGCCAACAATGGGGTTAACCGCAAAAGCCgg > 1:728075/1‑297 (MQ=255) tCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgcggcgtaaatgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggcaattacgcgc < 1:188064‑M2/298‑267 (MQ=255) gCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagtttggggcaattgatcggcg < 1:285220‑M2/298‑269 (MQ=255) aCGGCTGTCGGATGCG‑GCGTaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgacggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggaggcggcgtgaaccccctatccgcccttcggctatgctctggccggtttggcgttggcaacgattaacctatcggattggggcaatttcccgcgctcgcccaacc < 2:278076‑M2/298‑279 (MQ=255) aCGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGCATTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCCCTTTACTGGCGGCAAAACCTG‑CCCCGCCAACAATGGGGGTAACCCAAAAAGCCGCAGCCCCGCCCAcc > 2:13306/1‑298 (MQ=255) gATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCAGACCTACGGTTAGGTTCTGGCTCGTTGGCCTTGGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGACTTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCACTTTACTGGCGGCAAACACTG‑CCGCGCCAACAATGGGGTTAACCGCAAAAGCCGCAGCCACGCCCACCGTCGCAGaaa < 1:40061/298‑1 (MQ=255) gTaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgacggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggcaattacgcgccctcgtcaaatcattgcgctttttctttac > 1:278076‑M2/1‑2 (MQ=255) | TCAGGCCGTTCGCCGCTAGCAATTGTTCACTTACCAGGTTAAGACTCATCGTTTTTGCTACTCGTTAGTTACTGCAGTAGAGGATTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCAGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCG‑GCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACACTTCGTTGATTTGCGGATCGTCCAGCGGACCCGAAATGTGATAGCGC‑AAAATGGAGACTTTGCTCCACAGCGGCCCCAGCACTTTACTGGCGGCAAACACTG‑CCGCGCCAACAATGGGGTTAACCGCAAAAGCCGCAGCCACGCCCACCGTCGCAGAAATCTCTG > CP006584/3513776‑3514362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |