New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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? | CP006584 | = 4334576 | 7 (0.110) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein |
TAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGT‑TGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187791‑4188086 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ACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTAT > 1:332769/1‑299 ACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGC > 1:495652/1‑299 GTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCC > 1:506221/1‑299 AACCCTCTTAGCTTAAAATTTATCCACAAATTGTTTCGGTTTGGGGAAATTATGAGGGCATTGCTCAGGGCTAACCCCCTTTTTAGCTGGAAAGCACTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGC < 2:691712/299‑1 CTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTTCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGTGCTCCTTGGCGGCGCTA > 2:367472/1‑299 TAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTAT > 1:701386/1‑299 TAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCCGCCTGGTGCTACGGTCGGCCTCTCTGGCGGCGCcct > 2:214076/1‑296 GCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGC > 1:30959/1‑299 TATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCCGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGGTATTTGGGCGGCCTCTTTGGCGGGCCTCTTCCACCACGTCA > 2:287706/1‑299 ATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGTGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGCATTCCTCTTTCCGCAGCGGATTAAATTTATTGCCGCAGTAATCTGCGCGGTCCTATGTGCGCCCACTCCGTCGCCGCTTTGCCGCTACGcttc > 2:171138/1‑295 ATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGC > 1:446815/1‑299 ATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGC > 1:368673/1‑299 ATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGC > 1:361170/1‑299 TTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTC > 1:126857/1‑299 TTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTC < 1:367472/299‑1 cGAAATTATGAGTGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTATGGTTTTTCTCTACTCTGCTACCGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑CTCGTGGAACAAACGGCATTCGCTACTAGCCGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTCTTCCTCTTTCCGACGCTGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGACGTGGTGCTATTGCCGGCCTCTCGGGCGGTGCTCTGCCACCAGGTCCTCTCCGGGCAGtcttcccccccac > 2:429279/2‑286 GGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAACTTATTGCCGCAGGAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGCCGGCGCTATGCTCCTACGGCATCTACGGGCAGGAGTTTCCGCAGA > 2:199649/1‑299 AATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCG < 1:287706/299‑1 GGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTT > 1:277743/1‑299 GGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCGCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGACTCTCCGCCGGTCGTTCTGTTT > 2:327186/1‑299 CAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCG < 1:112840/299‑1 AGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTCAAATTATTGCCGCAGTAATCCGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTCTGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGGTCTCGCAGCGCGTTCTGTTTGTGCTTTTCGc > 2:446821/1‑298 TAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGT‑TGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187791‑4188086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTT‑ATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCGA < CP006584/4334576‑4334280 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |