| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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gggggGTCCCTCAGGGTTGGGAACGGTCCGTTGCCCATCAAAATGTTAAAGCATGGTAA‑TGTCATCACAGCGCTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGAGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAgg < 2:640802/298‑1 (MQ=255) ggATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAA‑TGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCaa > 1:147012/1‑299 (MQ=255) aTCTCTCGGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAAGGCAGGGTAA‑TGTCATCCCAGCACGGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAg < 2:170587/299‑1 (MQ=255) aTCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAA‑TGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGAAATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTATTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTGGTTCATTGTCTAACCTGGATATTTAAGGAAAAg > 2:305938/1‑299 (MQ=255) tctctcAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAA‑TGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGt > 1:9768/1‑299 (MQ=255) tctcAGGGTTGAACACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAA‑TGTCCTCCCAGCACAGGCACAGGAAAAAGTGAACTTAGTGAAGAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACTACATTAGATGTTGCACCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGTCg < 2:716099/299‑1 (MQ=255) | AGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACAT‑GGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAA‑TGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAA‑CCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGTCG > CP006584/4187792‑4188379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |