New junction evidence | |||||||||||
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? | CP006584 | 4565632 = | 5 (0.080) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
TTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGA‑TTCGTTTGATGT‑TATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGA‑TGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACcaaaatcattaggggattcatcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/4496425‑4496128 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TTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACG < 1:425860/299‑1 AAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACT < 1:726757/299‑1 ATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTGATGTTTTACTTTCCTGTTTAATCAGTTACTGGTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCGATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCA < 2:722462/299‑1 ATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGT < 1:6634/299‑1 AGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCT > 2:372833/1‑188 AGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCT < 1:372833/188‑1 CAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTTGT < 1:134071/299‑1 gGGGGCTGAGAAGGGTAGGTAATTAGGCAATTTTATTGTTTGACTTTCTTTTTTATTCAGTTACTGCTGGCGTGGGGGGTGGTCCAGGGGGGTTTTGCTGGGTTGGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTGTCGGCACCATATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGGGGTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTTGTG < 2:516310/298‑1 TTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGA‑TTCGTTTGATGT‑TATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGA‑TGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACcaaaatcattaggggattcatcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/4496425‑4496128 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTTGTG > CP006584/4565632‑4565952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |