| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 1840765 = | 6 (0.090) | 59 (0.930) | 54/588 | 0.2 | 90.8% | intergenic (+248/‑63) | LY180_08735/LY180_08740 | pyruvate kinase/murein lipoprotein |
| ? | CP006584 | = 1840785 | NA (NA) | intergenic (+268/‑43) | LY180_08735/LY180_08740 | pyruvate kinase/murein lipoprotein | |||||
CTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGCGAACGATCAAAAATAAGTGCCTTCCCATCAAAAAAATATTCTCAACATAAAAAACTTTGTGTAATACTTGTAACGCTACATGGAGATTA‑ACTCAATCTAGAGG‑GTATTAATAATGAAAGCTACTAAACTGGTACTGGGCGCGGTAATCCTGGGTTCTACTCTGCTGGCAGGTTGCTCCAGCAACGCTAAAATCGATCAGCTGTCTTCTGACGTTCAGACTCTGAACGCTAAAGTTGACCAGCTGAGCAACGACGTGAACGCAATGCGTTCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTGGACAACATGGCTACTAAATACCGCAAGTAATAGTACCTGTGAAGT > CP006584/1840489‑1841079 | tcctttaatattgcttttgtgaattaatttgtatatcgaagcgctcttatgggcgctttttttatttaatcgataaccagaagcaataaaaaatcaaatcggatttcactatataatctcactttatctaagatgaatccgatggaagcatcctgttttctctcaatttttttatctaaaacccagcgttcgatgcttctttgagcgaacgatcaaaaataagtgccttcccatcaaaaaaatattctcaacataaaaaactttgtgtaatacttgAAAAACTTTGTGTAATACTTGTa > 1:512341‑M1/277‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |